李之芳闻讯后，立刻面见康亲王，向他提出应将占用的民房退还原主，以安定民生。康亲王马上同意了。康亲王对李之芳仅以区区数千人的兵力守住衢州十分敬佩，与他商议对付耿军之策。

　　李之芳对康亲王说：“虽然耿将马九玉、朱怀德部的军营深沟高垒，且有数万叛军屯驻，似乎一时难以攻破，但他们转运粮草，都以衢江右岸的大溪滩为咽喉之地，只要我们从他南面的江山走小路袭击，叛军一定会军心不稳，不战自退了。”
　　康亲王虽然认同李之芳的计策，但由于耿军势众，地形又复杂，且又是长途奔袭，中途难免不暴露目标。康亲王不太放心地问：“叛军声势不弱，夜袭有把握吗？”
　　李之芳断然回答：“胜之无疑！”
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　　于是康亲王调配人马，准备出发。李之芳知他心中还有顾虑，临送行之时，又对他说：“我对叛军的情形很了解，明日此时，王必定可以见到捷报。”随后又叮嘱：“此时若还犹豫，必然会沮丧士气。”
　　康亲王见他成竹在胸，心里终于踏实了些，带兵上路了。
　　次日上午，清军果然如愿攻取了大溪滩。康亲王没有想到，耿军在大溪滩的防卫竟如此松懈，他不得不佩服李之芳有先见之明。
　　康亲王正要察探耿军主力此时的动静，却不料耿军大将马九玉已派人来，欲向他暗中纳款投诚。
　　原来，马九玉与耿藩留守在福州的中都尉徐光武私交很深，当初马九玉赴衢州接替江元勋时，曾委托徐光武照看他留在福州的家小，还要他时刻注意福州方面的动静。此时，徐光武见郑经军威日盛，耿军却已是人心惶惶，气势日衰，于是，他暗中派人携密信，赶赴衢州马九玉处，要他速迎清军入闽。

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　　其实，马九玉早就不看好耿军能抗衡清军，但是，他的家小被留在福州，实已沦为人质。所以，他在衢州虽然常跟清军交战，但总是留有余地，不轻易杀戮而已。
　　到这时，康亲王才恍然大悟，怪不得马九玉的中路耿军在衢州的战绩一直不佳，原来如此。康亲王向马九玉许诺，如果他能立下大功，将奏报圣祖给予他优厚的官爵待遇。于是，双方秘密约定：在马九玉引导清军进入仙霞关之前，双方还要在仙霞关下“大战一场”。然后耿军“惨败”，顺势退入福建，清军随后跟进。
　　之后，马九玉按约定于十五日夜退兵。十六日一早，康亲王的探马哨巡，马九玉的耿军营寨果然已空，立即报于康亲王。
　　于是，康亲王杰书携将军赖塔、副都统马哈达、总兵李荣、随征福建提督段应举、浙江温处道姚启圣等，率清军自衢州启程，向南赶往仙霞关，于八月二十日抵达关前。这时，马九玉已率耿军前来迎战。
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　　康亲王立在一座古庙旁的大树下指挥，两军在仙霞关前奋勇冲击，杀声震天。康亲王所在的古庙大门都被火器所穿，他的卫兵赶紧将门板拿来，挡在康亲王身前保护，康亲王谈笑自若，镇定指挥。耿军人虽多，却缺乏统一调度，各自为战，很快即被气势如虹的清军击溃，开始漫山遍野四散奔逃。
　　马九玉见已达到目的，即率身边仅有的三十余骑饶关而逃，另从山河口分水关入闽。
　　把守仙霞关的耿军参将金应虎傻了眼，他没想到耿军那么多人马，眨眼间烟消云散，败的干干净净。领兵主将马九玉逃之夭夭，守关的不少将吏也被裹挟而逃。金应虎势穷力竭，只好献关投降。
　　清军过了仙霞关，长驱而入，从北向南涌进福建，一路上马不停蹄，势如破竹，于二十三日进至浦城，挥军攻克。该县有一个叫石塘的地方，是由浙入闽的要隘，由耿将连登云把守，清军士气正盛，很快将其杀败。九月三日，攻取建阳县，随后，又进取了建宁府，打开了通往福州的道路。

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　　这时，傅喇塔留一部分人马继续围温州，他自率一军走云和县，再由庆元县的山岭小路取道赶往福建松溪。由于道路艰险难行，傅喇塔不慎骑马坠崖，牙齿都摔脱了两颗。他干脆牵马以鞭作杖，餐风饮露，最终抵达建宁府，与康亲王会合。
　　兴化本是福州的南部屏障，守将马成龙闻听清军已入仙霞关，知道耿精忠大势已去，即遣人往漳州见郑经，向他进献兴化府。
　　其实，长期的战乱，已使福建民不聊生，这时，固守温州的曾养性因粮食匮乏又向耿精忠告急，耿精忠勒令布政使萧震捐银五千，以筹集粮饷。萧震此时已暗通清军，他以自己家贫答复，耿精忠大怒，令校尉擒拿萧震，将他绞死于南门瓮城。同时，派吏曹郑章、右都尉徐鸿弼带兵在福州城内到处抄家，共搜刮银两十余万。

　　福州左都尉王进闻清军已入仙霞关，不日将抵福州，便秘密联络已在福州被囚两年多的原建昌知府高天爵，两人与把总杨起鹏、姜山、武举胡守谦等共同谋划，遣千总徐得功联系清军，意图里应外合拿下福州，剪灭耿党。但因计划泄露被耿精忠察觉，遂于九月四日均遭杀害。
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　　盘踞在江西广信一带的耿军白显忠部，见康亲王大军已从仙霞关进入福建，便带兵直趋闽赣交界的分水关，声称将要攻打建阳，断绝入闽清军的后路。浙江总督李之芳一面派兵拒阻，一面遣使游说白显忠，许以高官厚禄。白显忠知道耿藩大势已去，权衡利弊后，率领所部向清军投降。
　　九月十八日，圣祖谕令康亲王杰书：王率领大兵大败贼众，已入闽境。耿精忠虽背恩反叛，念小民遭遇贼乱，困苦已极，朕心深为恻然！期以时事晓谕耿精忠速降，以副朕安辑生民之意。
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　　耿精忠先后失去了马九玉、白显忠两路大军，又闻报清军已进抵建宁，距福州只有数百里路程，且兴化也被郑经占据，顿时惊慌，感觉已到了穷途末路。
　　耿精忠忙召集诸将商议，说：等到最危急关头，就乘船入海，或者做海寇，或者去投奔郑经。中都尉徐光武反对说：“郑经与殿下乃是仇人，岂有自己为王却依附于海寇的道理。且殿下系皇亲，倘能悔悟，皇上必不见罪，不可心生疑惧而受祸！”
　　耿精忠想逃难海上，但他享福惯了，实在吃不了苦。与属下商议了几次，始终意见不一，踌躇不决。
　　康亲王根据圣祖的指示，再次写给耿精忠一封招降信，允许他保留王爵，仍镇守福建。耿精忠得信，立即答复：“自愿归诚，恐部众不从，致滋变患，望赐明诏，许赦罪立功，以慰众心，乃可率属降。”

　　耿精忠担心自己罪恶深重，得不到赦免，他还希望朝廷再下一道公开的赦诏，才放心投降。康亲王当然不能答应，因为在此关键时刻，再向朝廷请示，时间上也来不及。因此，他不再理睬耿精忠的要求，率领大军继续向福州疾进。
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　　清军随后抵达延平，守将耿继美献城投降。福州已遥遥在望。耿精忠得知这一消息，震惧无措，只好决定投降。
　　原福建总督范承谟已被他整整拘押了两年半多，受尽折磨，他害怕范承谟揭发他的叛逆之罪，这关系到他的生死。
　　范承谟被押两年多来，没换过一件衣服，通身生虮虱蚊蝇，任其钻咬，蓬头垢面，疾病缠身，每天仅吃半碗饭，只求速死！天天他都骂一阵，然后写诗文，没有笔砚，就用烧过的煤炭灰，写在墙壁上。
　　专门看守范承谟的狱卒里面有一个名叫徐应虎的，很敬佩范承谟的忠义，常劝慰他等待时机，后来又受泰宁人许鼎贿托，服侍范承谟愈发周到。他闻听康亲王大军已进福建，耿精忠的部属不愿意下海做海寇，都准备剃发投诚。
　　徐应虎赶紧密报范承谟，为他高兴说：“大人终于得见天日了！”
　　范承谟苦笑着说：“如果真是这样，我的死期将至了。”
　　徐应虎惊讶地问：“大人何出此言，三年尚不相害，现在都准备投降了，竟又起杀心？”
　　范承谟答：“你有所不知，彼（耿精忠）必不敢让我活，以存行迹”
　　日期：2021-03-29 22:00:19
　　之后，范承谟用烧尽的炭灰在牢房的墙壁上写下一首绝命诗：
　　一笑襟开万愁平，龙兴有诗葬真卿，执旗厉鬼争前导，扫尽穿墙穴必鼪！
　　九月底，耿精忠决定杀人灭口，斩草除根。半夜时候，派他的心腹吕八带人前往范承谟的拘禁处，逼范承谟自尽。范承谟当时正卧床未睡，徐应虎报之。范承谟站起身来笑说：“今日才毕吾事！”
　　即披衣，准备行，吕八厉声吆喝。范承谟怒目欲裂，举手中械索摔他，被狱吏拉开。遂往北叩首说：“罪臣奉职，不能为国家除此叛贼，死已迟矣！”
　　吕八大怒，喝令从者将范承谟缢死。又往别的囚室，把范承谟的幕客、亲属以及看守他的狱卒，共五十三人，全部秘密处死。然后，将范承谟尸体焚烧，骸骨丢到野外，不留任何痕迹。
　　耿精忠先派官员奔赴延平，献上他的“总统将军印”，接着，又派儿子耿显祚同被他先前扣留的朝廷使臣周襄绪、陈嘉猷一起，前往迎接康亲王来福州。