身为镰仓幕府的缔造者之一，北条政子的演讲，安定了大部分御家人们的心，镰仓幕府的三路大军在进发的途中不断地有武士前来归附，一路走一路壮大，北路北陆道大军达到了四万人，中路东山道大军达到了五万人，而南路东海道大军，更是达到了十万人之多。
　　面对幕府的十九万大军，朝廷也开始慌了。
　　得知军队已经壮大到了十九万人之后，北条义时得意地扬言到：“暂且先让上皇大人预览这十九万大军吧，要是觉得人数不够的话，关东还有二十万大军整装待发，到时我一定亲自率领他们进京上洛！”
　　在之前，尽管也有打着“清君侧”旗号的战争发生在京畿附近，可是真正敢将矛头指向上皇的，只有北条义时一人。后鸟羽上皇原本以为镰仓幕府只会固守镰仓，万万想不到北条义时居然敢孤注一掷，尽举东国之兵上洛。朝廷为了抵抗幕府大军，派出了藤原秀康为主将的官军，分兵前往美浓国、尾张国布阵。
　　最早赶到尾张的是武田信光率领的中路东山道大军，东山道的幕府军沿着信浓国走山路赶到了美浓国，而他们面对的守卫大井渡口的官军则仅仅只有两千余人。
　　武田家乃是源义光之后，家族素来以骁勇善战闻名，这次大井渡口的战斗，更是以众击寡，武田家的一门众武将个个身先士卒，跃入河中强渡。尽管官军顽强抵抗，可是人数差距过于悬殊，很快就败下阵来。
　　日期：2015-04-18 12:36:41
　　大井渡口兵败的消息很快就传到了藤原秀康统领的官军主力那里去了，此时藤原秀康以及三浦胤义统领着一万余人官军，守卫着大豆渡口。
　　“必须马上驰援大井渡口！”三浦胤义说到。
　　可是保守的藤原秀康却退怯了，他想了想，对着三浦胤义说到：“我想，我们应该退守京城，北陆道的叛军很快就会从越前国南下近江国，然后切断我们退往京城的退路的。”

　　藤原秀康的担心不无道理，官军毕竟人数太少，本就无法应对袭向尾张国、美浓国的两路幕府大军，要是再被北陆道的幕府军给包饺子了，那么这一万多人就全得交待在这儿了。
　　可是，退守京城，就意味着被动挨打，就意味着，这场战争的失败。
　　其实，在北条义时决定举兵，大江广元建议即刻进攻京城的时候，朝廷就已经失败了。
　　南路的东海道幕府大军穿过三河国，到达了美浓国南部的尾张国，令他们意想不到的是，尾张国进入美浓国的必经之地墨俣，只有山田重忠带领着一支孤军在此守卫。

　　山田重忠自知不敌幕府大军，只好丢下防线，灰溜溜带着手下逃走。
　　南路东海道大军渡过墨俣川，进入美浓国，进而兵不血刃拿下了大豆渡口，与中路东山道大军合流。
　　而此时，后鸟羽上皇费尽心思，也只纠结了两万多人，分驻宇治川、势多构筑防线。而不久之后，北路的北陆道大军也南下与其他两路幕府军汇合，兵势达到了近二十万人。
　　幕府军士气高昂，而官军只能在宇治川死死挣扎。
　　六月十三日，镰仓大军休整之后到达了宇治川。此时正是夏天的雨季，天降大雨，官军又拆除了宇治川上的桥梁。幕府军趁夜跃进暴涨的宇治川之中强渡，却遭到了官军的顽强抵抗，损失惨重，幕府军只得暂缓攻势。

　　要是被朝廷阻拦在宇治川的话，幕府的“兵贵神速”之计就没有任何意义了，可是强渡宇治川，会不会因为伤亡太大而导致士气低落呢？就在北条泰时纠结的时候，他的长子北条时氏前来请命担任先锋。
　　日期：2015-04-18 12:37:28
　　“祖父在镰仓运筹帷幄，父亲在军中统领全军，在下也要为北条家尽一份绵薄之力。”北条时氏这么说道，“请父亲大人让在下出任先锋吧！”
　　看到长子如此英武，北条泰时高兴不已，同意了北条时氏的请求。
　　次日，北条时氏带着本部人马，率先跃入了宇治川之中，而其他幕府军也造出了木筏强渡宇治川。幕府军本就人多势众，此番又受到大将的感召，更是如狂风扫落叶一般向官军攻去，而官军根本无法抵抗镰仓大军的攻势，宇治川的防线很快就被攻破，败亡的官军只得逃回京城。
　　官军的将领山田重忠，三浦胤义，藤原秀康等人逃回了京城，想要面见后鸟羽上皇，以商对策，可是上皇的御所却闭门不开，不肯见这三名将军。
　　“上皇大人，如今我们总要商量对策啊！”三浦胤义在御所门外大喊道。
　　后鸟羽上皇见大势已去，根本不敢再见他们，只得让护卫的武士出来对三浦胤义说到：“你们想怎么办就怎么办吧。”
　　三浦胤义等人顿时感到了绝望，自己怎么就会支持这么个庸主呢？在大叹庸主误我的同时，众将又带领着残军返回去与镰仓大军作最后的决战，最终，如石沉大海一般，全军覆没。
　　三浦胤义带着其子躲藏在寺院里，最终被幕府大军包围，自杀而死。山田重忠也在顽强抵抗幕府军之后自杀。而藤原秀康，逃亡到了河内国，自知无法逃脱幕府的制裁，为了避免受到羞辱，也自杀身亡。
　　其余的官军武将也要么自杀身亡，要么被幕府捕获，或斩首，或流放。
　　镰仓大军进入京城之后，北条泰时住进了昔日平家的根据地六波罗府，时隔多年，平氏再一次占据了六波罗府。（北条家出自平氏）
　　日期：2015-04-18 12:37:47
　　后鸟羽上皇知道此次罪责难逃，可是还对镰仓抱着最后的一丝希望，希望镰仓不会对“治天之君”上皇下手，将参与本次倒幕的六名公卿悉数捆缚，交给了镰仓。并且声称此次倒幕行动都是谋臣所为，与己无关。这六名公卿，除了藤原忠信以外，均被镰仓斩首，而同时参与倒幕的人的三千多处庄园也均被镰仓没收，赏赐给有功的御家人。
　　而尽管后鸟羽上皇很不要脸的将罪过都推给了手下人，可是这种自欺欺人的想法也只能安慰一下自己罢了。朝廷有史以来第一次遵从幕府的意思，废掉了后鸟羽上皇立下的仲恭天皇，改立高仓天皇的孙子为后堀河天皇。后鸟羽上皇作为本次倒幕的主谋，被流放到了隐岐岛；而顺德上皇因为支持父亲的倒幕行动，被流放至佐渡岛；土御门上皇虽然不支持父亲和兄弟的行为，却因为是后鸟羽上皇的儿子，也被流放了，不过他的待遇稍微好一点，流放到了四国岛的土佐国去。

　　除了处理朝廷公卿和上皇，镰仓幕府还废除了原本设立的京都守护，改设立六波罗探题，由北条义时之子北条泰时和北条义时的弟弟北条时房出任，负责监视京城以及西国的御家人的动向。

　　“承久之乱”被日本人称为前所未有的“下克上”，因为身为朝敌的北条义时居然逆袭了朝廷，敢于对朝廷举起战刀的镰仓幕府最终居然成功了。这极大地损害了天皇以及公卿的权威，让武士们看到了公家的懦弱无能，对公家的态度也从恭敬，变成了鄙视，最终无视。