眼瞅着无法登陆的忻都便决定暂时放弃登陆九州岛，待到南路军前来会合后再说，反正南路军都是汉人炮灰，不管抢滩登陆死了多少他也不会在乎。
　　可是等归等，这段时间里东路军总不可能在博多湾钓鱼吧，忻都的目标，改成了博多湾附近的志贺岛上，志贺岛位于博多湾北部，退潮的时候会露出一片浅滩，连接日本九州岛本土。可是事情却大大出乎了忻都的预料。
　　日军的抵抗大大超出了文永之役，而且此次日本人也已经熟悉了元军的战法，在对阵之中元军并占据不了优势，几仗下来，元军的伤亡便超过了上千人，连副帅洪茶丘。
　　除了白天打仗，晚上日本人也不让蒙古人好好休息，夜里，日军搭乘小船，举着火把前来骚扰元军，打不打得到元军不要紧，关键是让你们别想睡觉。虽然偷袭对元军造成不了多少伤亡，夜夜敲锣打鼓前来偷袭的日本人却搞得元军有些神经衰弱了。
　　为了预防夜袭，忻都决定让大船将小船围起来，晚上让大船的士兵值夜班，小船的士兵睡觉。这样一来，偷袭的事情是少了，可是却又出现了新的问题。时值盛夏来临，元军终日泡在海里，再加上大船围着小船，使得空气不流通，东路军中发生了严重的瘟疫，让元军的兵力大大减员。

　　忻都只好率军退回壹岐岛，气的直骂娘：“这些南蛮子怎么还不来？”
　　实际上，南路军之所以迟迟没有到达日本，实在不是因为拖延症，而是因为在出发之际，主帅阿剌罕突然死了。
　　忽必烈决定派阿塔海接替阿剌罕的位置，可是范文虎却认为东路军早已出发，此时不宜久等，便不等阿塔海到任便出发了，临阵换帅等琐事使得南路军的出发足足推迟了一个月。
　　日期：2015-04-27 20:43:00
　　就在东路军翘首以盼，希望南路大军前来打破僵局的时候，九州岛的豪族如萨摩国岛津家，丰后国大友家，肥前国龙造寺家等，率着一门郎党前来进攻壹岐岛。
　　经过苦战之后，元军不得不放弃了壹岐岛，退到了海上。
　　南路军经过远航，终于到达了日本，与东路军会师，两军驻扎在九州岛西北部的鹰岛上头，并且南路军带来了忽必烈的最高指示——进攻目的地改为日本的平户岛。

　　南路军的主将范文虎看到东路军的惨状，便又有些怯敌了，这名将军当年正是因为怯敌不战而降，投靠了蒙古人，现在老毛病又范了。
　　元军总数达到了十四万人，而九州岛的日军则只有四万余人，不过元军得到了最新的消息，日本中国地方（中国：指日本本州岛西部）有一支人数约六万人的日军正星夜赶往九州岛。
　　会合之后的元军与日军接连交战，却没占到便宜，只得一直龟缩在鹰岛之上。
　　蒙古人崛起于草原，是个内陆国，没有海军，忻都自然不熟悉海战要领，而范文虎则是南宋陆军将领，也是不谙水战。元军不懂得将战船分散停泊，以防风暴，而将战船紧紧相连地排在了一起，这给元军造成了致命的打击。

　　七月三十日，台风造访了日本，也造访了鹰岛上的元军，经过一夜的暴风雨，数千艘战船均身葬海底，仅余下几百艘。不过当时大多数士兵都驻扎在岛上，并没有在船上。
　　南路军只有张禧所部将战船分散停泊，损失不大，可是没了船，就等于没了退路。
　　张禧向范文虎进言说：“我军尚有一战之力，不如我们召集剩下的士卒背水一战，用剩下的船只进攻九州岛。”
　　范文虎答道好：“好。”
　　然后在台风过去的第二天，抢了一艘战船朝西驶去。
　　忻都等将领本来对眼下的局势一筹莫展，看到有范文虎作为版样，高级将领们便也各抢了一艘船向西驶去。
　　日期：2015-04-27 20:43:31
　　张禧叹了一口气，决定放弃自己所部船上的战马，将平户岛上幸存的江南士兵共四千余人搭上了船，也离开了日本。

　　接下来，岛上剩下的元军还有数万人，可是都没了高级将领，只剩下了小兵。前头说过，南路军中除了士兵外还有不少工匠，于是小兵们只好拿起手上的工具，准备自己砍伐树木，建造船只回国，可是日本人却没有给他们这个机会。
　　得知台风席卷了元军战船的日军兴奋不已，在范文虎等人离开后迅速率军进攻了鹰岛。一开始，元军还能抵抗日军一阵子，但是此时岛上的元军已经是无头的巨人一般，很快就丧失了斗志，战场局势呈现了一边倒的态势。
　　经过弘安之役后，回国的元军仅有两万多人，而日本方面抓的俘虏，也仅有两万多人。
　　这说明了此次弘安之役元军惨败，伤亡达到了十万人之众——这无疑是一个天文数字。
　　得知第二次征日惨遭失败的忽必烈的感到面子尽失，盛怒之下下令再次建造船只，做好第三次伐日的准备，可是元朝朝廷中的大臣纷纷反对，并且拿出了隋炀帝三征高丽，最终劳民伤财，国破身死的例子提醒忽必烈。

　　忽必烈是个雄主，或许有些残暴，但却并不是昏君，他也知道，江南的汉人远比其他民族更为顽强，南宋虽然亡国，可是宋朝遗民们无时不刻都在想着恢复大宋江山，再加上蒙古人的残暴统治，江南各地都爆发了大规模的反元起义。要是再不顾百姓疾苦，逼迫宋民建造船只，只怕会更加激化矛盾。而且除了起义之外，元朝内部的政局也十分不稳定，蒙古人不像中原人，有着严格的嫡长子继承制度，成吉思汗死后，传位于三子窝阔台，窝阔台又传给了长子贵由，贵由死后，汗位被成吉思汗四子拖雷的儿子蒙哥夺取，最终落到了蒙哥的弟弟忽必烈的手上，这自然引起了成吉思汗三子窝阔台的子孙不满，窝阔台一系的子孙时时刻刻都想着要夺回本属于自己的大汗位子。国内矛盾重重，在南方还有安南的大越国（越南）

　　日期：2015-04-27 20:44:09
　　对自己不安好心，因此，忽必烈在大都嚷嚷了几天要灭了小日本后，也没了声音。
　　而日本方面，将俘虏的元军分成了两类，元军之中的蒙古人，高丽人，女真人以及北方汉人（金国统治之下的汉人）均被处死，而原南宋的降兵却被留了下来，这些宋人来自高度发达的江南，熟悉工匠技艺，于是镰仓幕府在博多湾新增了一个唐人町，供这些俘虏居住。
　　北条时宗在得胜之后，甚至一度想要反攻大陆，进攻朝鲜，不过日本为了抵御元朝的入侵，已经耗尽了国力，需要一定的时间用来回血，因此这个计划就被搁置一旁了。
　　关于此次弘安之役，蒙古人认为是台风救了日本一命，日本人也认为是“神风”救了自己一命，然而，真的仅仅是神风吗？
　　实际上，无论是文永之役还是弘安之役，日本武士都让元军见到了自己作战顽强的一面，元军是侵略者，而日军则是保家卫国的一方。纵使在文永之役之中，日军遭到摧枯拉朽般的失败，却也做好了与元军同归于尽的打算，元军有大弓，有巨弩，有火器，可是日军却毫不畏惧，勇往直前。弘安之役之中，熟悉了元军战法的日军，更是在作战之中让元军尝到了不少苦头。