庆喜也终于坐不住了。他认为这个征讨命令和王政复古的大号令一样，乃是以萨摩藩为主的倒幕派所策划的政变，并非朝廷的本意。事已至此，双方交战已是避无可避，庆应四年一月二日，针对由公武合体派急转为倒幕派的叛徒萨摩藩，再加上种种咄咄逼人的恶行，庆喜制成了“讨萨表”列举萨摩罪状，率大军从大阪出发上洛。
　　三日午后，德川陆军部队与萨摩藩兵在鸟羽街道展开了激烈的枪击战，正式拉开了鸟羽伏见战役的序幕。萨摩藩兵向伏见奉行所进行炮击后，位于奉行所北侧的御香宫也开始不断发射炮弹，而守卫在奉行所的是传习第一大队、会津藩兵与新撰组150人部队。但与手持新式武器、长期接受洋式化军事训练的萨摩兵相反，会津、新撰组都是重装上阵，除了刀、枪等冷兵器外，所拥有的基本都是旧式武器，在火力上就比对方差了一大截。

　　传习队镇守南北两门、新撰组则是负责守卫后门。伏见奉行所内先后飞来十余枚炮弹，土方岁三见奉行所已经支撑不住，便下令永仓新八、岛田魁、伊东铁五郎、等十余名队士组成敢死队，翻过近两米高的奉行所后墙冲锋陷阵，与敌人进行白兵战。
　　论火力，毫无疑问是萨摩藩占绝对优势。敢死队员刚一翻上后墙，便不断被萨摩及以下支藩用枪扫射，死伤惨重。永仓、岛田等见战友一个接一个倒下，化悲愤为力量，硬是在枪林弹雨之下翻上墙头冲入敌方阵营，以手中刀剑与敌人展开了殊死的搏斗。“敢死队”顾名思义，以冲锋陷阵、斩杀敌人为最优先原则，完全将生死置之度外。永仓、岛田等敢死队员的勇猛竟然压制了手持先进武器的萨摩兵，敌人见势不妙，暂时撤退了。

　　枪、炮不长眼，附近的百姓家很快便被流弹轰炸，各处起火，百姓们本沉浸在新年的愉快气氛当中，此时却不得不在寒冷天气中匆忙逃离，逃得慢点的便与房屋一起被炮弹击毁。

　　萨摩军暂时撤退，新撰组的敢死队员们也暂时松了一口气，打算撤回奉行所。这时永仓因一身装备过重，又在白兵战中体力消耗严重，到了奉行所后墙却怎么也翻不上去。以“怪力”而著称的岛田一看永仓的窘相，便从墙上伸出步枪让永仓抓住，自己单手便轻轻松松将永仓拽了上来，把一旁的众队士惊得张大了嘴，连声齐叹大力士岛田魁名不虚传。
　　日期：2013-12-21 13:01:53
　　↑淀城遗迹
　　五十六、鸟羽伏见的战争（败退篇）
　　元月三日的鸟羽伏见开幕战基本就是以幕府方的大败而收尾。然而萨军也着实赢得不轻松，入夜之后便火速“让”天皇授予了节刀，高竖“御锦旗”（也有前一年便由萨摩大久保利通、长州藩士品川弥二郎等人秘密制好之说），并委任仁和寺宫嘉彰亲王为征讨将军。从这一刻起新政府军便升级成为“官军”，而以会津、桑名两藩为首的旧幕府军便沦为“贼军”。
　　为防天皇落入幕府之手，大久保利通提出建议：发布讨贼诏书、让明治天皇在萨长两藩的护卫下转移到芸州、备前一带（“让”和“转移”是本句亮点，而不是“请”和“移驾”）；由岩仓及有栖川宫声东击西，制造天皇已前往比叡山的假象。
　　四日，战地由上鸟羽转移下鸟羽，但是新政府军中竖起了“御锦旗”，代表天皇亲赐“大义名分”，一下就将旧幕府军定义为“朝敌”，原本呈旁观之势的诸藩也因此纷纷倒戈，投入新政府大军行列。
　　然而东军（旧幕府军）众兵士大惑不解：我们不是官军吗？不是拥有大义名份讨伐制造朝中混乱的奸贼萨摩藩吗？现在怎么就沦为“反贼”了？
　　禁门之变后，长州藩也曾被朝廷下令追讨，一时间成为反贼。但“长州反贼”的御诏乃孝明天皇亲自所下，皆因长州藩从八月十八日政，变、池田屋事件、禁门之变等一连串事件中为所欲为、妄图以武力威胁朝廷并火烧京都挟持天皇等滔天大罪而下令征讨，可以说长州的“反贼事件”完全是他们咎由自取，怨不得别人。但扣在以庆喜为首，会津、桑名等旧幕府军的“反贼”的帽子，却是由岩仓、萨长等一步步设计陷害，东军的“反贼”罪名来得实在是冤。

　　御锦旗的出现、诸藩的落井下石，给东军（幕府军）造成了极大的心理压力，军中士气大减，连连败退。
　　就日本的“二元制政治”来说，天皇和幕府都是诸藩的主人，也可以说，天皇和幕府这一对主人同时养了近三百条看门护院的家犬。然而养狗之人都清楚，在两个主人进行掐架的时候，狗通常会采取三种不同的应对方法：
　　一、帮助厉害的一方；

　　二、帮助弱小的一方；
　　三、不知该帮谁，只在一旁无助地乱吠。
　　这主人打架时“狗的三项原则”，在幕末最大战役——戌辰战争序幕战（鸟羽伏见战役）中表现得淋漓尽致。
　　墙倒众人推，破鼓乱人捶，眼见幕府沦为“反贼”，大批的大名立刻倒戈相向，加入讨幕大军（狗的三项原则之一）；山内容堂等将此事定义为旧幕府军与萨摩藩之间的私怨，置身事外（狗的三项原则之三）。另外三项原则之二会在之后的叙述中提到，这里暂不剧透。
　　四日的战役就在极度混乱中以幕府军的大败惨淡收场。但东军的恶梦此时仅仅是个开端，远远没到结束的时候。
　　会津藩、新撰组败退至淀城并提出了入城请求。淀藩藩主稻叶正邦虽为幕府老中，但此刻居然害怕遭受连累，断然拒绝了东军的入城请求。被幕府老中抛弃，相当于在本就伤痕累累的东军伤口处又撒了一把盐，所遭受的打击与心理压力可想而知。
　　无奈，东军只得放火烧了淀小桥，撤大军至淀千两松方面。
　　六日晨，冲锋在最前线的新撰组、会津藩等东军与西军（新政府军）在八幡、桥本附近展开了激战。淀川对岸的山崎关门本是连接京都与大阪的要冲，是东军最后的处点。然而守卫在那里的津藩（藤堂藩）竟然临时叛变，隔着淀川向东军侧面开炮，东军一直将津藩当成同盟，突然被袭防不胜防，被打了个措手不及。永仓新八气得将津藩藩主藤堂高猷祖宗十八代都挨个问候了一遍，心说敢情你孙子这是为你传说中的私生子报仇雪恨还是怎么着？

　　战况激烈，在千两松的攻防战中，新撰组多名主力成员先后战死，其中包括新撰组创设元老井上源三郎、同样为元老级别的监察役山崎丞（后在富士山丸中因伤重不治去世）。井上源三郎的侄子井上泰助当时只有12岁，作为近藤的小姓加入新撰组。见叔叔中弹战死，含着泪割下了他的头颅准备带回安葬。戌辰战争结束后，他曾对家人说道：
　　“从未想过人的头颅竟然这样重……”
　　腰间挂着头颅的泰助跑动缓慢，其他队士实在看不过去，便对他吼道：
　　“提着那东西你怎么跑！马上就会被追兵抓住杀头的！不是不能理解你的心情，现在逃命要紧，赶快扔掉！”