但是对于魏忠贤来往的使者，孙承宗则是稍显不太买账，按理说地方大员对于这些京城使者一定是毕恭毕敬，但孙承宗加衔太子太保，本身又是东阁大学士领兵部尚书，是一等一的大员。更何况，孙承宗对于魏忠贤一党是相当抵斥的，所以，针对于这样的宦官使者，孙承宗只是用普通的清茶招待，简单到了极点。但是这样做，或者说与魏忠贤打擦边球。还是会有风险的。
　　（五）小心的孙承宗 暂时的不倒翁
　　天启三年，问题出现了，问题出现在孙承宗自己的班底里，实际上，孙承宗镇守辽东期间，虽然朝廷风起云涌，但孙承宗有天启帝朱由校的支持，加之自己的斡旋，外人一直无法攻破他的防线。但最终，问题，出现在他自己的班底里。因为他的政敌或别有用心的人知道孙承宗背景深自身又无懈可击，要下手，就只能从他的部属里开刀！
　　到了天启三年五月，孙承宗认为，当初自己所推荐的辽东巡抚阎鸣泰并不称职，因为很多关于辽东军事应对的问题，阎鸣泰并没有更好的建议。
　　更何况，阎鸣泰此人“而实无才略，工谄佞，以虚词罔上而已”，当初熊廷弼派遣他前往沈阳，这厮走到虎皮邑，竟然大哭而返，丢人丢到了辽东！但是，面对孙承宗的说法，阎鸣泰自己却不这么认为，并为此很不情愿。
　　因为当初孙承宗决定不能只是专守山海关的时候，曾经与部属进行过探讨，而对此提出相应具体主张的有两个人。一个为阎鸣泰，另一个，则是袁崇焕。袁崇焕认为，应该坚守宁远，屏蔽山海关重地。而阎鸣泰则认为应该防守觉华岛，也就是说袁崇焕认为应该着重陆地防守拱卫山海关，而阎鸣泰认为宁远陆地靠近后金控制范围，并不好防守。倒不如防守海岛觉华岛，这样就能使得不擅长水战甚至没有接触过水战的努尔哈赤无计可施。综合了两种观点之后，孙承宗采纳了二人的说法，一方面派遣重兵驻守宁远，另一方面以偏师驻守觉华岛，这样一来，宁远守军与觉华岛水师便可以互相照应，一旦双方再次开战，觉华岛守军可以利用水师的便利经由三岔河绕道后金侧背，进行攻击。而就算双方没有开战，宁远的进战也可以拓地二百里，后金就算进攻，宁远距离山海关也够遥远，足以成为屏障，就算前方战事失利，后方也有着相对充裕的反应时间，何乐而不为呢？因此，孙承宗立即派遣袁崇焕率军五千进驻觉华岛，参将金冠率军进驻觉华岛。这是阎鸣泰在辽东军事规划被采纳的一次表现。但此后，孙承宗能力超群，阎鸣泰在他面前根本没有发挥的机会，因此内心也常怀不愿。在这样的情况下，孙承宗上奏朝廷，而朝廷立即罢免了阎鸣泰。顺便提一下，阎鸣泰此人后来投靠了魏忠贤。

　　而在这之后，廷议决定由右佥都御史张凤翼接任阎鸣泰的职位，但此人胆小怕事，此时，却是又生出了许多事端。
　　（六）胆小无能的张凤翼
　　自从王化贞丢弃广宁后，关外八城尽空，虽然孙承宗锐意修复新城，但是由于孙承宗刚刚到辽东，还没有来得及全部修筑。因此，当张凤翼得知这件事之后，内心打起了小九九，因为在他看来，孙承宗去辽东至今已经九个月，却还是未见起色，而孙承宗又身为阁臣大佬，估计，这是不打算在山海关常驻，是要返回朝廷了！而这个时候，将辽东那一大摊子烂事交给自己，这不是害他吗？因此，张凤翼此时，十分的恐惧。为什么？因为辽东巡抚按制，此时当驻宁远，可是宁远此时荒无人烟，地处前线，后金军随时可能出现，这太危险了，不行，自己绝对不能去送死！因此，张凤翼立即上奏，请求专门把守山海关，关外之地，干脆通通不要了！当时首辅叶向高是他的老师，另一位阁臣韩爌还是他的同乡，按照张凤翼的想法，自己的奏疏一定能得到认可。但是此时，无论是叶向高还是韩爌都是压下了他的这一想法，因为此时，专守山海关是不得皇帝之心的。所以，张凤翼只得到达山海关，但是张凤翼仍不死心，天启三年八月，当他到达山海关三个月后，张凤翼终于鼓起勇气前往巡视前屯、宁远等地。而这时，他的小算盘再次打响，当巡视过后，张凤翼立即上书朝廷，奏疏里极力的赞扬孙承宗到辽东一年后的建树，但是在他的奏疏后面，却有着这样的一段话：

　　“八城畚插，非一年可就之工;六载疮痍，非一时可起之疾。今日议剿不能，言战不得，计惟固守。当以山海为根基，宁远为门户，广宁为哨探。”
　　很明显，张凤翼在这里虽然提出要以宁远作为门户，广宁当做前哨，但是他却说，辽东的修复恢复非短时间能做到，现如今力量不足以进剿，只有防守。而说来说去，他的防守重点，还是山海关，宁远只不过是一个藩屏之地，那样的话，也就无足轻重了。而既然如此，他这个辽东巡抚，也就可以安然无恙。因此，这封奏疏，张凤翼很巧妙的为自己的胆小做了个开脱。但孙承宗不是吃素的，自然明白了张凤翼的小九九。

　　可是此时，在孙承宗的部下里，有着大多数人主张退守山海关，这时，张凤翼内心极其的高兴。但是，有着大多数人同意，自然也就有人不同意。首先，孙承宗倚重的大将马世龙主张，应该驻守中后所。