从新组建的汗廷，主少国疑，有着众多觊觎者。不拿出点厉害的手段便难以服众，达延汗刚刚即位，满都海夫人便将达延汗装在皮箱中挂在自己战马上，亲自领兵上阵，远征卫拉特。
　　也先死后，卫拉特人虽各自为政，但仍保持着强大的实力，杭爱山一带，以及蒙古故都和林都在其掌控之下。满都海夫人一路猛攻，在博尔塔拉（今新疆博克塞里蒙古自治县）大败卫拉特人，将其赶到杭爱山以西，收复了和林。
　　但卫拉特人仍然不愿意接受汗廷的支配，满都海夫人也无法彻底征服他们，只能在军事胜利后与之签订盟约，规定卫拉特部长的住帐只能称宅，而“不得称殿”，其“冠缨不得过四指”[3]，杜绝了卫拉特人拥立可汗的可能。同时，让达延汗迎娶阿剌知院的孙女为侧妃，以联姻的方式安抚卫拉特。
　　草原上最为看重的便是武功，无论男女，只有能够在军事上表现出成就，便会受到拥戴，达延汗还小，满都海夫人受到众望所归，被授予“彻辰”称号（意为至高无上），汗廷威望直线上升。

　　有了实力，剪除权臣便是必然。那位害死达延汗生父巴彦蒙克，一直希望独揽大权的亦思马因太师成为了满都海彻辰夫人下一个目标。在满都古勒汗去世时，他没能趁机兼并汗廷人马，满都海夫人远征卫拉特时，也没有趁机作乱。只顾着骚扰频繁明边，结果被明朝名将王越击败，损失惨重。结仇于前，松懈于后，是典型的自杀行为。
　　1483年，满都海彻辰夫人派少师托郭齐率军进攻亦思马因太师，大军艰苦征战，几乎横扫了东起辽东地区，西至哈密北山的蒙古草原。亦思马因太师兵败如山倒，丢弃妇孺，仓惶西逃。最后靠着自己也出身于卫拉特，才在卫拉特诸部的领地上站住脚。
　　在日后几年中，亦思马因联络卫拉特部分首领东侵，希望恢复势力，一度也让汗廷颇为紧张。《蒙古源流》记载，满都海彻辰夫人在一次领兵拒敌时，因为怀孕身体沉重，从马上掉下，险些成为俘虏，可想而知战斗之激烈。但亦思马因最后还是被击退，没能东山再起。
　　1486年，托郭齐少师率军彻底击溃了亦思马因残部。亦思马因被托郭齐少师亲手射死。汗廷的最大威胁被解除。
　　太师既死，满都海彻辰夫人于是彻底改革官制，废除了元朝遗留下来的太师、太尉、太傅、太保、少师、平章、知院等官职。而代替以成吉思汗时代的济农、诺颜。左右北元近两百年的“太师”终于成为了历史陈迹。
　　大约在1487年左右，已经16岁的达延汗开始了亲政，满都海彻辰夫人从台前退居幕后。她如母亲一般养育教导了达延汗；作为妻子，为达延汗养育了七个儿子；而作为摄政辅臣，又在达延汗亲政前帮他扫清了身边所有的障碍。

　　作为一个女人，她的作为几近完美。
　　（四）右翼之乱
　　在达延汗时代，蒙古本部经过百余年的分化整合，逐步形成几大势力。除汗廷直接控制的部落外，还有永邵布部、鄂尔多斯部、蒙郭勒津部、喀尔喀部、兀良哈部、科尔沁部以及朵颜三卫。
　　经过满都海彻辰夫人时期的铁腕执政，永邵布部、鄂尔多斯部、蒙郭勒津部、喀尔喀部、兀良哈部已经相继归附汗廷。
　　亲政后的达延汗面对的局面相当安定，在最初几年，他按部就班的用怀柔手段逐步扩大汗廷的实力。

　　在呼伦贝尔东部和大兴安岭以东的嫩江流域，是成吉思汗二弟哈撒儿后裔所属的科尔沁部，此时实力雄厚，号称“二十万科尔沁”。达延汗对之克尽兄弟之礼，并保证绝不会拆分科尔沁原有部落，也不派汗廷官员管辖，只需他们向可汗效忠即可。科尔沁部首领鄂尔多固海审时度势，归附汗廷。
　　而对朵颜三卫，达延汗通过联姻、结盟和互访等方式，逐步将他们纳入自己的统治之下。
　　和风细雨，润物无声，年轻的达延汗让蒙古本部的各首领都在名义上服从于汗廷，在表面上做到了政令统一。
　　但这种统一是极不稳定的，各部首领实力雄厚，大汗的政策一旦触及到了他们的既得利益，便会战火频起。
　　亲政后第十年，战乱不可避免的暴发了。

　　1509年，达延汗任命次子乌鲁斯博罗特为右翼济农，掌管永邵布、蒙郭勒津、鄂尔多斯三部。
　　这一任命使得永邵布部首领亦不剌、鄂尔多斯部首领满都赉的极为不满，于是暗中联络蒙郭勒津部首领火筛，决定发动叛乱。
　　鄂尔多斯是成吉思汗陵——“八白室”所在地，乌鲁斯博罗特济农刚一到任，便到八白室拜祭。亦不剌等人趁机在典礼上向济农的侍从挑衅，双方发生争执，遂致殴斗。乌鲁斯博罗特济农手下大臣巴布岱一时冲动，将亦不剌的手下砍死。
　　一直在等待机会的亦不剌等人立即大呼：“刚来此处便草菅人命，日后还不得将我们斩尽杀绝么！？”这句话就是信号，一时间，八白室内外伏兵四起。
　　面对这突然的变故，乌鲁斯博罗特济农的属下毫无防备，虽拼死保护主人的安全，并夺得马匹让济农逃走，但终于寡不敌众，乌鲁斯博罗特济农在混乱中被杀。
　　“八白室之变”发生时，达延汗的三子巴尔斯博罗特正在土默特部探亲，闻变后趁夜色逃走，一路上以打猎果腹，在饥寒交迫中赶回汗廷，向父亲报告了事变经过。

　　一夜之间，风云突变，右翼三部叛离，还折了爱子。达延汗勃然大怒，决定亲征讨伐。
　　鄂尔多斯、永邵布两部都兵强马壮，而且还是护卫八白室的“大有福者”。达延汗不得不认真对待，不但让左翼察哈尔、喀尔喀、兀良哈三部集所有丁壮参战，还向科尔沁部发出谕旨，要求援助。
　　科尔沁部首领鄂尔多固海此时已经被达延汗封为“诺颜”，正愁没有报效的机会，接到谕旨后带领其子布尔海率主力前来。汗廷所能调集的军队几乎倾巢而出。
　　而在叛乱者一方，亦不剌、满都赉都是直接置乌鲁斯博罗特于死地的祸首，自然没有退路，集中所有精锐准备迎战，而蒙郭勒津部的火筛此时看到汗廷来势凶猛，便玩起了坐山观虎斗，不派兵参战。
　　天平倒向了汗廷一方。

　　达延汗率大军到达答阑特里温之地时，右翼军队已经先期抵达，双方对峙，谁也不先出手。此时，右翼军队数量大约有三万人，而达延汗的部队则有5到7万人。
　　右翼军是背水一战，生死存亡全系于此。而汗廷军则有些七拼八凑，求战之心不够热烈，若是对峙久了，便会士气低落。为了速战速决，达延汗派布尔海、巴嘎逊塔布囊和巴尔通三将率小股骑兵为先锋，冲击叛军阵营，诱其出阵。
　　果然，早已绷足了劲的右翼军一遭到进攻就如堤坝破口一样，大军宣泄而出，以弓形阵向汗廷军发动猛攻。达延汗用以诱敌的部队几乎全军覆没，布尔海阵亡，但战略意图已经达到，而且让失去儿子的科尔沁首领鄂尔多固海红了眼睛，率军死战。
　　面对敌军的弓形阵，达延汗将军队编为六十一组，以牛角阵形迎击。同时，命兀良哈军单独列阵，并将自己的大纛矗立于其军阵当中，诱惑右翼军队主攻方向。
　　亦不剌、满都赉看到这面大纛，认为达延汗便在兀良哈军中，指挥其主力向之猛攻。兀良哈军以一军之力哪里抵挡得住，经过激战后败退，但右翼军队主力亦有相当损失，锐气已失，人马俱疲。
　　趁此机会，达延汗高举起代表可汗的黑色大纛，指挥全军向右翼军队发起猛攻，一举击溃其主力。亦不剌、满都赉率残部败走，达延汗紧追不舍，直追到柴达木，将满都赉斩杀。亦不剌逃到哈密，被白帽回所诱杀。

　　见到亦不剌、满都赉败亡，蒙郭勒津部的火筛连忙向大汗表示忠诚。右翼的叛乱平息。
　　基于对这次叛乱的反思，达延汗决定将本部各部落进行重新划分，而以自己的儿子为各部之首，避免动乱。
　　在答阑特里温之战后不久，达延汗册封三子巴尔斯博罗特为右翼济农，统领三部，而以四子阿尔苏博罗特统领蒙郭勒津部的七个鄂托克，划为土默特部。
　　土默特部首领火筛见到大汗要把自己的部落拆分，又用济农剥夺了自己对部落的治权，这才后悔没有与亦不剌等人一起反叛。此时虽然孤掌难鸣，但为了权力也不得不铤而走险，于是发动叛乱。
　　以一部之力起兵，胜算绝少。虽然在图尔根河(今呼和浩特之大黑河)一战中，火筛主动出击，一度使得汗廷的讨伐军陷入混乱，达延汗本人也因乘骑陷入泥泞而狼狈不堪。但最终还是战败，火筛被迫投降，不久郁郁而终。他的蒙郭勒津最终完全被巴尔斯博罗特济农统管，成为其世袭部落。
　　至此，蒙古本部所有不安定因素全部解除，达延汗开始了他一生中最影响后世的业绩——分封诸子。
　　（四）分封诸子

　　作为皇帝，儿子多虽然使得后继有人，但往往也会有很多麻烦，例如皇位之争错综复杂，甚至会导致国家败亡。但对游牧国家的可汗来说，儿子多的好处便远远大于弊端，成吉思汗有五个儿子，除最小者阔列坚之外，其他几个儿子都有自己的封国。虽然互相之间也免不了骨肉相残，却让黄金家族在世界上活跃了400余年。