消息传到汗廷，科尔沁诺颜摩罗齐进言道：“右翼诸部逐渐坐大，对汗廷没有丝毫好处，不如将之拆散，合并于大汗直属万户中。”对于被夺走汗位余怒未消的博迪汗采纳其言，暗中布置人马，决定一劳永逸的解决右翼三万户。
　　正在博迪汗紧锣密鼓的安排攻打右翼之时，他的母亲安桑太后闻讯，将他召到面前劝道：“你的祖父（达延汗）当年征讨右翼叛乱后，对于蒙古人自相残杀已经深恶痛绝，提出当年40万户蒙古如今只剩6万户，如果再遭残破，即使成为天下共主，又有什么乐趣？你现在要攻打你的兄弟，且不说你三叔的几个儿子都骁勇善战，你未必能够取胜，即使取胜，你祖父打下的基业也会毁坏殆尽，那时候，你有什么面目去见祖先？”

　　博迪汗听了母亲的劝告，停止了行动。老妇人的一席话免除了蒙古内部一次严重的内讧，也让俺答没有在立足未稳时便遭到打击。随后，博迪汗开始主动加强与右翼众堂弟的联系，免除猜忌，俺答也开始了自己的征战。
　　作为中兴之后的第二任可汗，博迪汗仍是将明朝和卫拉特作为自己的头号敌人，内部的纷争平息之后，博迪汗开始向明朝用兵。
　　从1521年开始，博迪汗多次进攻明边，1523年甚至攻打到北京密云附近，虽然未能对明朝造成实际威胁，但也让大明皇帝损兵折将，头疼不已。
　　而正当博迪汗乐此不疲的骚扰明边时，后院突然起火，由大汗直辖的左翼三万户之一的兀良哈万户，反叛了。
　　兀良哈万户是达延汗所封六万户中唯一一个没有由其儿子管辖的万户。这大概是为了表彰其在平定右翼叛乱时立下的显赫战功。但兀良哈众首领借此居功自傲，屡屡不服汗廷管束，不断地与其他万户发生摩擦。
　　1524年，兀良哈万户的诺颜突畦、格儿博罗特起兵攻打喀尔喀万户，汗廷派使者调解也完全不理。这样的行为，已经是公然叛乱。

　　颇有乃祖之风的博迪汗立即采取行动，亲自率人马前去平定，右翼济农衮必力克以及俺答也率军协助。这一年，俺答年仅16岁。初出茅庐便表现不俗，在巴勒吉地方（今蒙古国肯特省北部巴尔吉河流域）大败兀良哈军，“大有掠获”。
　　但兀良哈万户人口众多，势力庞大，一次战胜并不能使其伤筋动骨。博迪汗于是在1531年、1533年又连续两次进攻兀良哈，俺答每次都率军参与，功勋赫赫，而且获得了大量属民和财物，自己的实力不断壮大。
　　1538年，博迪汗几乎调集各万户所有精兵第四次征讨，已经残破不堪的兀良哈再也无法抵挡，突畦、格儿博罗特等诺颜率部投降。
　　博迪汗这一次终于过了一场拆分重组的瘾，召集所有贵族在汗廷举行庆功宴，等所有人都酒足饭饱后，便下令将与会的兀良哈大小首领全部处死。然后与其他万户的堂兄弟们彻底将兀良哈万户拆分，所有属民化整为零并入其他五万户当中。
　　除了大汗直属的察哈尔万户之外，在这次大兼并当中最得益的，便是战功最高的衮必力克、俺答和他们的四弟伯斯哈尔，他们分得属民最多，顿时成为了“暴发户”。非但如此，博迪汗还赐予他们汗号，分别为“默尔根汗”、“索多汗”和“昆杜伦汗”。

　　从此，俺答便成为了俺答.索多汗，通称俺答汗。虽然这只是拱卫蒙古大汗汗廷的小汗，但俺答从此便有了汗号，有了自行其是的充分理由。
　　博迪汗的这次册封是为了进一步拉拢右翼诸万户，让他们不再觊觎大汗汗位，可惜，他最终还是会后悔不迭。
　　因为，他给俺答的，不仅仅是一个汗号，而是他夺取蒙古最高统治权的一个阶梯。
　　（三）西征
　　在与兀良哈的征战中，俺答汗已经将自己的部落经营的兵强马壮，在拆分兀良哈万户时又获得了更多的属民。这样一来，除了大哥衮必力克之外，他成为了右翼三万户最强大的贵族。
　　不久，俺答汗便兼并了四叔阿尔苏博罗特的土默特部，仅留了一个鄂托克给他的儿子。土默特部占了蒙郭勒津万户的大半，俺答控制了土默特部，也就间接控制了蒙郭勒津万户。在这之后，右翼三万户中便出现了土默特万户，而蒙郭勒津万户则不再为人们提起。

　　有了这样的实力，又有了大汗赐予的汗号，俺答汗开始了以拱卫汗廷为名义的东征西讨。
　　当年达延汗评定右翼叛乱，亦不剌、满都赉虽然败死，但其残部却与卫拉特的也力克部合流，在青海、河西走廊一带盘踞，将那里的曲先、罕东等蒙古卫蹂躏得四处逃亡，成为西部一大势力，被称为“撒里畏兀儿”，多次向东侵扰。
　　俺答汗首先将他们作为自己的主要打击目标，与大哥衮必力克多次发兵西征，撒里畏兀儿的首领卜儿孩抵挡不住，所部几乎解体，被迫将女儿奉献给衮必力克换取暂时平安。从此，右翼三万户的势力扩展到青海一带。
　　1542年，右翼三万户济农、“默尔根汗”衮必力克去世，虽然他的儿子继承了济农职位，但在强大的二叔面前只有俯首帖耳的份。俺答汗遂成为右翼三万户实际上的首脑。
　　既然成为首脑，便要作出比前任更杰出的成绩才行。1543年，俺答汗率领土默特、鄂尔多斯两万户军队渡过黄河，穿越星忽拉(今内蒙古乌拉特中旗新忽热乡所在地)山口，绕道贺兰山再经古浪所(今甘肃省古浪)，穿过黑松山(今甘肃冷龙岭)从扁都口进入青海，继续征讨蛰居在三角城(今青海省海晏县治)一带的卜儿孩。

　　此时的卜儿孩虽然已经没有多少抵抗意志，很快投降。但已经习惯自由自在的撒里畏兀儿人却不愿意就此臣服，与俺答汗所部发生激烈交战，混战中，俺答汗腿部受伤，为了不动摇军心仍端坐马上指挥作战。属于自发作战的撒里畏兀儿人没有统一指挥，终于不敌军令严明的讨伐军，逐渐溃散逃遁，其余均缴械投降。俺答汗敬佩他们的英勇，没有处罚他们，将他们归属自己的幼弟恩克迪尔岱青管辖。

　　青海、河西走廊一带完全纳入俺答汗的势力范围。在他回师后，将大量缴获的财物奉献给博迪汗，这既是炫耀，也是一种威胁。
　　博迪汗继承了祖父的勇气和果断，却也继承了祖父不尽人意的身体，此时的他已经身染重病。为了安抚俺答汗，他不得不打破常规，再次赐予其“土谢图汗”封号，这已经几乎与蒙古大汗的汗号相似。
　　1547年，44岁的“阿剌克汗”博迪去世，竟然与祖父的年寿一样。他的长子达赉逊继位，号“库腾汗”。
　　达赉逊汗知道自己无法与俺答叔叔较量，而汗廷所在地又离俺答太近，于是下定决心，率领汗廷及左翼诸万户东迁，到辽东一带驻牧，离开这个危险越远越好。
　　作为臣下，俺答汗亲自送别大汗车驾，并给予很多礼物。而作为叔叔，他迅速的将侄子原来的地盘妥善保管——全部收归囊中。

　　达延汗留下的江山，已经有大半成为了俺答汗的领地，他向着大汗之位又跨进一步。
　　1558年，“库腾汗”达赉逊病逝，其子图门即位，号“札萨克图汗”。年轻的大汗一登基便开始了加强汗权的种种举措，并对辽东一带的女真、达斡尔、鄂温克等部族进行征服，扩大汗廷实力。
　　但对于俺答汗来说，这个年仅20岁的侄孙要想对自己构成威胁还差得远。他没有理睬图门汗要求他到汗廷“述职”的旨意，而是再次西征青海，清缴撒里畏兀儿的残部。
　　这次出兵没有什么难度，很快便达到目的返回，但在回军途中，俺答汗遭遇了一支土伯特的商队，因为互不了解，发生冲突，商队全被俺答汗的部下俘虏。
　　这本是一个极为细小的事件，甚至都不值得在史书上记下一笔。对于每天都在面对战争的蒙古人来说，这么一次战斗算得了什么？
　　但在商队中有1000名喇嘛。这些饱读经书的佛徒见到了俺答汗，他们向他表达了佛祖的祝福，让他知道他面前的这些俘虏不是可以成为他的奴隶的，因为他们已经侍奉了伟大的神明。
　　这是14世纪中叶以后，蒙古人第一次接触到藏传佛教的僧侣。也许是佛徒们的话让俺答汗感到震撼并随之平静，也许是对于祖先曾经甚为推崇的宗教的尊重。俺答汗释放了这些喇嘛。

　　这个时候的他，也许还没有意识到，自己以后会与藏传佛教发生多么大的关系。甚至改变了蒙古人的历史。
　　一年后，俺答汗率领右翼各部首领和部众数万人再次进入青海，这一次，他停留了两年之久。
　　在这两年中，他招降了卫拉特人的中明安部，与东察合台汗国的沙汗建立联系，互派使节，稳固了自己的西部根据地。而最大的收获，则是娶到了卫拉特的奇喇古特部首领的女儿做自己的侧妃，这个女人便是蒙古历史上著名的钟金夫人，汉文史籍中称为“三娘子”。
　　1560年秋末，俺答汗起程回返。抱得美人归之余，他把自己的儿子丙兔台吉留驻于青海，占据了原罕东左卫的驻牧地。行至大、小松山时，阿勒坦汗让鄂尔多斯万户的爱达必斯达延诺延、贝玛图台吉和鄂克拉罕伊勒登诺延率部留驻这处咽喉要地，保证自己往返青海的道路畅通。