元治元年四月，土方给老家的姐夫佐藤彦五郎写了一封信。
　　“我于去年春天上洛，虽然目前为止无太大建树，但如果为了将军家千秋之基业，就算战死也绝无怨言。请你把这封信当成一封遗书，我死后没有东西什么可以送你，就把这日记与头盔赠与你留作纪念吧。”
　　从这封信中可以得知两件事：一是土方已决心在京都为将军舍命而战；其二便是土方此时已为完全的佐幕派，决定了新选组今后的发展方向。
　　这个时候的新选组，工作范围仍然是市中巡逻、取缔不法浪人，与京都守护职、京都所司代共同分担京都全域的巡逻工作。实际上这种工作并非近藤等人心中所愿，他们上京的目的打从新德寺清河大演说时就已经明确，那就是将军的护卫工作。四月二十四日，新选组日后的竞争对手——“京都见回组”诞生了。这个组织是从御家人子弟中选拔出的、根红苗正的武士集团。与此同时，开始流传着将军家茂即将返回江户的传言。近藤听闻后心中更加不满：说好的将军护卫呢？如果这次将军东下返回，那么新选组存在的意义，便只剩下巡逻、视察工作了。

　　关于新选组的今后的发展、去向问题，近藤与土方商议许久，始终也没能得出个结论。其实新选组本身是个很矛盾的存在，它不像其他的组织、集团，有着明确的需要尽忠的主人，它是由众多浪士组成，而且并不完全属于任何一个藩主，这在日本的历史上几乎是史无前例的，因此它本身就处在一种极其尴尬的立场，近藤的迷惘也是情有可原的。
　　日期：2013-11-05 00:51:24
　　但近藤毕竟是近藤，只迷惘了一段时间，便重新确立目标，准备主动出击了。五月三日，近藤写了一封关于新选组的未来发展的建白书，经由会津藩转呈老中。
　　“……（前略）我等皆为尽忠报国的有志之士，去年承蒙厚爱得到市中警卫巡逻之权利，不胜感激。但是，我等上洛目的是为了保护将军安全而并非市中巡逻，如果将军就此返回江户，那么我等此番上洛便全无意义，勉强留在京都恐怕也只会令诸位徒增烦恼。因此，请立即下令遣散新选组，让我等辞职返乡吧。”
　　这一封言辞恳切的建白书，表面上看起来饱含一腔爱国热血，但要概括总结成一句大白话，那便是：你若不让我守卫将军，我便辞职返乡。

　　以辞职威胁老中，这在江户幕府的历史上恐怕还是头一回。这近藤并非真的想要告老还乡，他心里清楚，目前维持京都治安人手不够，此时正值用人之际，幕府怎么也不会放任拥有超强战斗能力的新选组解散，因此近藤玩的是一出以退为进的高招。当然，他这一步棋还有另外一个目的，那就是成为幕府家臣，鸟枪换炮彻底改变浪士身份。
　　老中在看完这封建白之后，果不其然，老中不愿遣散新选组，说是京都治安紊乱，现在正值用人之际，希望新选组各位大局为重，暂时继续维持治安的工作云云，临了还给众人发下一笔抚恤金，以安抚众人心态。
　　随后，由于见回组成员招聘进行得不顺利，应征的御家人是少之又少。正巧赶上近藤建白书事件，老中便知会京都守护职的会津藩，由他们出面劝说近藤勇，将新选组整个并入见回组麾下，并给予全员“同心”阶级的待遇。
　　这“同心”乃是幕臣中的最下等，而且这见回组的首领，也必然会由位高禄厚之幕臣担任，轮不到他近藤勇的份。即使得了个低级幕臣身份，一局之长宝座丢了不说，整个倾注了试卫馆一行人心血的新选组都会落得被其他组织吞并的下场。思前想后，近藤在与町奉行商量之下，决定拒绝这次的招安。
　　于是见回组改由成功刺杀清河八郎的与力之一——佐佐木只三郎接管。

　　日期：2013-11-05 18:39:04
　　↑新天神桥，现已为钢筋桥
　　十七、大阪与力暗杀事件
　　元治元年五月，由于在1858年签署的“日米通商修好条约”的影响，生丝、锦织物等一些进口商品统统被外国人垄断，连同茶叶、纤维等日常生活用品的价格也翻了几倍。雪上加霜的是，这段时期京都、大阪的米价突然暴涨，使得本来就对高腾的物价怨声载道的老百姓，日子过得更是苦不堪言。
　　但是这开港所造成的外国人垄断商品而导致国内物价飚升，也是历经了好几年才造成如今的恶劣影响，而米价竟然在短时期内暴涨几倍，这无论怎么说也于理不合。这事传到了新选组的耳中，近藤与土方商议之下，觉得此事定有蹊跷，于是派了监查方山崎丞乔装成普通老百姓潜入大阪一探究竟。

　　这山崎丞本名林丞，是文久三年五月左右招上来的队士，摄津大阪出身，香取流棒术的达人，同时善使短薙刀。由于山崎为大阪出身，对于京阪的地理、民情风俗等非常熟悉。此人不仅善于筹措金钱，而且相当有外交手腕，连土方岁三都对他另眼相看。不仅如此，山崎性格稳重、低调、服从管理，上面传达下来的任务必定忠实地完成，是新选组中出了名的模范队员。因此入队刚刚数月便从诸士取缔役、监察役擢升为副长助勤，深得土方信任。

　　根据山崎的深入调查，发现米价暴涨之事乃是大阪与力头取内山彦次郎在背后搞的鬼。所谓与力，其实是町奉行辅佐，负责行政及警卫、审判等工作。这内山彦次郎是长州激进派，他本人也对幕府抱有敌意，平时早就做好了被佐幕派杀手暗杀的准备，因此在房间内暗设密道以便随时逃走。内山受了长州人唆使，在暗处鼓动大阪米商狂抬米价，旨在使百姓生活苦不堪言，从而激发百姓对幕府的仇恨。

　　山崎在查明真相后不敢怠慢，立刻返回屯所将此事汇报给了近藤与土方。近藤一听立刻火冒三丈，这内山老儿当真是不识好歹，去年的帐我还没跟你算清，今天你竟然屈从于奸人之奸计妄想煽动百姓造幕府的反，真是不知天高地厚。天堂有路你不走，地狱无门你闯进来，既然如此，这次是必须要给这老头儿点颜色看看了。
　　要问近藤为何如此激动，事情还得追溯到文久三年六月的“大阪力士乱斗事件”。近藤等人将一纸状书送到了町奉行所，当时内山彦次郎就在负责录口供的役人之中。这内山彦次郎早就听说壬生浪士组曾经敲诈大阪富商钱财，于是对他们的印象是相当恶劣，问话的态度也是极其强硬，针对一个细节上刨根问根，冷嘲热讽，把近藤勇气得丢下一句“我等只为处理力士尸体一事前来通报，并非接受此等无理审问，我等从属会津侯管辖，如有疑问请直接向会津侯询问吧！”说完当场拂袖走人。

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　　大约在三十年前，大阪也曾出现过一次米价暴涨事件。那时是1833年，正值日本全国的大规模歉收，也就是世间所说的“天保的大饥荒”。与之前的“享保的大饥荒”、“天明的大饥荒”并称为“江户三大饥荒”。大范围的歉收使得全国人民的生活痛苦不堪，就连有“天下的厨房”之称的大阪也不例外，米价暴涨紧接着带动其他物价纷纷上扬，出现了大批买不起米活活饿死的百姓。这时原大阪町奉行的与力——阳明学者大盐平八郎，看着众多百姓吃不上饭不断饿死的惨相，心如刀绞，于是便将自己所藏之书转手卖掉，将得来的钱分给那些吃不起饭的贫苦百姓，并多次向迹部山城守递出多次救助请愿，但都被驳回，自己还落了个多管闲事的下场。