当时负责接待英国公使帕库斯的老中阿部正外、松前崇弘大吃一惊，当即表示，无论如何请务必通融一天，一日后必定做出回答。
　　二人立刻将事情的经过禀告给了将军德川家茂。家茂闻言大惊，立刻执笔给一桥庆喜写了封信，十万火急地要求庆喜下阪商议大事。
　　但还没等庆喜来到大阪，在幕阁老中阿部正外、松前崇弘的强烈要求下，还是以暂不通知朝廷，由幕府单方面同意开港为结论结束了临时幕议。

　　阿部、松前二老中也并非昏庸至极，相反，这是他们经过了深思熟虑之后才做出的决定。此时时间紧迫，四国联军已集结军力于兵库湾，如果将此事上奏朝廷，那么一向攘夷为重的朝廷一定会严辞拒绝，如此一来，势必会引起四国联军围攻，到时京都便血流成河、生灵涂炭。
　　接到紧急文收的庆喜急忙转呈了朝廷，自己则是飞奔至大阪听取详情。可到了大阪进行了第二次幕阁会议，除了上述开港赞同案以外却没能再拿出第二个像样的方案来。但庆喜不希望朝廷和幕府因此关系破裂，便向家茂保证，朝廷方面由自己出面说服，次日再由家茂上京亲自向天皇解释说明。
　　紧接着，庆喜会同老中松平康英、大阪町奉行井上主水正，向四国联合军发表声明，声称幕府虽同意开港一事，但天皇乃一国之尊，此事必须奏明圣上，再经过朝廷同意方可开港。可这外国人没这么好说话，口说无凭，你得拿出点证据来。町奉行井上二话不说，拔出刀来就要砍自己手指头以示诚意。联合舰队的这边被吓得不轻，这町奉行官不大，胆子倒是不小，敢情这是个不要命的主。于是一伙人赶忙上前拦下。井上这么一闹，总算是再争取到了十日的期限。

　　这事儿很快就由庆喜转呈了朝廷。果不其然，朝廷一方是相当震怒，就连小小的大阪町奉行都能争取到十日的宽限，两个老中合力竟然只争取了一天，幕府要你们何用！便立即罢免了阿部、松前的官位，并下令二人石高减半，将二人赶回了老家。
　　这老中是幕府的重职，也就是德川家的执政机关，两位老中的下台就相当于幕府的威严扫地，是件十分严重的大事。而家茂紧急给庆喜传信，为的就是要让深得自己信赖的庆喜担任中间人，做好朝廷方面的工作。可工作不但没做好，自己下属的两位老中居然都被罢免，这庆喜到底安的是什么心？
　　九月下旬，围绕着再次征长的议题大臣们展开了了激烈的辩论。正在这讨论重要问题的朝议上却迟迟不见左大臣近卫忠房露面，一桥庆喜觉得奇怪，一经查明，原来这近卫是听取了萨摩藩大久保一藏（利通）的进言，坚决反对再次征长，而且迟迟不出席朝议，这会儿正跟大久保两人在私邸密谋呢。庆喜大怒，当场骂道：“受一介贱民的唆使居然连入宫的时间都敢推迟，如此草率地对待朝政，真是岂有此理！如此我等以将军为首全部罢官算了！”

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　　当时庆喜也是怒上心头，口不择言，但他当时还不知道，没过半个月，这句话竟然变为了现实。
　　兵库的开港、老中的罢免、幕府与朝廷的矛盾，在这内忧外患之下，将军家茂也是深感力不从心、心力交瘁，于是干脆响应庆喜号召，丢下一封辞职信，离开大阪往东边去了。
　　看到将军辞呈的庆喜是抽自己嘴巴的心都有了。
　　但是朝廷并不接受家茂的不辞而别。朝廷认为家茂所为是一种极不负责任的行为，未经准许就擅自辞去将军一职，这是对天皇的不尊重。若真欲辞去将军一职，至少要亲自上殿向天皇启奏。
　　得知朝廷动怒的一桥庆喜、松平容保、松平定敬，当即策鞭狂奔追赶家茂至枚方，以近藤为首，土方、冲田等新撰组队士追着容保公也追到了枚方。

　　见到了家茂，松平容保好言相劝，分析利害关系，是操碎了心，磨破了嘴，家茂好不容易才回心转意，跟着容保公返回二条城听候发落。此时新撰组作为将军的随行护卫护送家茂返京。
　　对于家茂无故递交辞呈这一事实，朝廷倒是没给他下什么严重处罚，但实际上已经是对家茂失望透顶。在老中罢免、征长会议中力排众议等一连串事件中表现抢眼的庆喜，这时候却与家茂相反，已是深得朝廷信赖。
　　日期：2013-11-28 19:50:42
　　三十八、萨长同盟
　　庆应元年（1865）十一月，将军德川家茂再次上奏朝廷并获得了第二次征讨长州的勅准。但此时幕府财政赤字严重，麾下各藩也并不配合，对于征长多持消极态度。这种情况之下如果强行发动战争，即使侥幸胜利，对幕府方面来说也意味着需要付出巨大牺牲。如果可以通过交涉来解决双方问题，那么便可以免去庞大的军费和人力，是为上上之策。为了确认长州方面的最终意向，前京都町奉行、现大目付（※大目付为监视各大名、朝廷动向以及密切关注一切对幕府不利情报的监察官，属老中级别。）永井尚志被派遣至最前线的广岛，与长州藩进行战前最后的谈判。

　　近藤勇带领参谋伊东甲子太郎、五番队长武田观柳斋、诸士调役（监察役）山崎丞、吉村贯一郎、尾形俊太郎，以永井尚志家臣的身份随行前往。然而这新撰组局长近藤勇的名号太过响亮，对于恨新撰组入骨的长州人来说，听到近藤大名恐怕直接就会一发炮弹丢过来，正式打响战役了。于是近藤在临行时变名，改称“近藤内藏之助”。
　　对佐幕一派、尤其是新撰组干部来说，这长州藩境内是真正的龙潭虎穴，强龙压不住地头蛇，稍不留神便会身首异处，落个死无葬身之地的凄惨下场。临行前，近藤抱着必死的觉悟，给家乡亲人和土方岁三的姐夫佐藤彦五郎写了封信。信中主要提到两条：
　　万一我遇不测，新撰组全权交给土方岁三接管；
　　二、立冲田总司为天然理心流五代目宗家。
　　寄出了信，近藤的心愿也算是了了一半。十一月下旬，永井、近藤一行人先到了广岛，永井以近藤等人为自己家臣为由，向广岛的长州藩代表提出了七人同行入国的要求。近藤等人化装成家臣本来是想瞒天过海，没想到反而引起怀疑，近藤以下六人均被拒绝入境。事后近藤等人一边打探当地情报，一边尝试多种入境途径，均以失败而告终。没办法，近藤、伊东、武田、尾形四人于十二月下旬暂行回国，留下山崎、吉村在当地继续刺探敌情。

　　此时长州已完全由激进派掌权。在经过了下关四国联合战争的惨败之后，高杉晋助猛然醒悟，一味地实行攘夷已是痴人说梦，单靠日本现有的军事力量根本无法与诸国列强抗衡，兜兜转转一大圈，现在看来还是幕府的开国方针是正确的、有效的、靠谱的。以高杉晋助为首，藩内先是与曾经敌对的英国和解并秘密达成协议，再周游于外围和欧美列强友好相处，扩展国际人脉以便增强本国军事力量。