对于后金绕道而攻问题，也不是袁崇焕独具慧眼。崇祯元年九月，兵部尚书王在晋言边患切在蓟门，并提出五点建议。一是晓瑜三十六家，防止与后金勾结；二是在关口险要之处多布火箭地雷；三是坚壁清野，使后金入犯之后，抢掠不到粮食；四是辽东方面积极策应，牵制后金；五是抚慰蒙古降部，使其为明朝效力。
　　十一月，直隶巡按御史陈睿谟忧心忡忡的奏称说今日后金窥视之情蓟州甚于辽东，今日之蓟州非昔日之蓟州。边外蒙古诸部尽归后金，东起三岔河西至宣府大同长边近二千里，对后金毫无阻拦，大有可虑。敌人知道关宁重兵难越，必绕道蓟州，到时蓟州百千关口，防不胜防。敌军清晨破边而入，傍晚就可驰抵北京，庚戌往事殷鉴不远。建议急修边墙、增强防御。崇祯认为有理，批转照此办理。

　　这是崇祯版狼来了的故事，天天喊狼来了，狼却迟迟不出现，于是大家都认为狼不会来，直到有一天，狼真的来了，高喊狼来了，没有人相信有狼，但狼却真的来了。
　　那么，后金突破蓟州边墙，袁崇焕身为蓟辽督师，要不要负责？负多大责任呢？
　　这也是三百年来，后人争论不休的话题。
　　袁崇焕重起后，官衔是兵部尚书兼右副都御史，督师蓟辽，兼督登莱天津军务。兵部尚书和右副都御史都是虚衔，只是为了加重袁的身份，实际上袁并不负责兵部和都察院的具体事务。督师蓟辽，看起来袁的军事管辖范围不只是辽东，还包括蓟州。但实际上袁能管到的是辽东、东江、登莱、天津四镇。这一点可以从崇祯二年八月，袁崇焕辽东四镇核定粮饷的奏疏中印证，袁上报官兵数十五万三千余名，粮饷四百八十万两，范围只包括上述四镇。

　　崇祯元年九月，崇祯有一道谕旨对蓟辽边防责任作了明确划分。谕旨明确指出：“关外由辽东督师袁崇焕相机战守；关内古北口、喜峰口等路由顺天巡抚王应豸严督蓟州三协道臣、将官分地控扼，以匹马不入为功；蓟辽总督喻安性急时东西策应，平时坐镇密云。”
　　崇祯二年五月，袁崇焕奉旨精简冗官，他政令所及包括关外辽东全境和关内关内道和永平道二道。在向朝廷的奏报中提到：至于顺天等处，则听当地督抚为政，他不敢越俎代庖。可见，其对蓟州地区的军政事务并不符实际上的责任，只是名义上的最高军事领导。
　　后金入犯后，袁崇焕上疏引咎请罪，崇祯做了如下批复：“卿治兵关外，日夕拮据而已。分兵戍蓟，早见周防，关内疏虞，责有分任。”。皇帝的批示，明确指出，蓟州方面的防务责任并不在袁，最具权威性和说服力。
　　皇太极十月初一率大军西行，为避免袁崇焕得知，取道锦州以北三百里以外，超出了当时明军的侦察范围，后来祖大寿把这一点作为辽东方面卸责的一个理由。祖大寿说的确属事实，也有他的道理，但是皇太极为了以求一逞，差不多是把后金能够出动的部队全部带出，而且沿途等候蒙古军来会，行军速度不是很快，路上走了近一月之久。这么大一支队伍在后金国消失了这么长时间，袁崇焕竟一无所知，如在梦中，对敌嗅觉如此之麻木，军事情报如此之迟钝，双方未曾对面交手，袁崇焕已经先输一招，不能说他没有侦探不明、失察之过。

　　到了皇太极仿效邓艾暗度阴平，破釜沉舟突入长城，斩杀当地明军如同砍瓜切菜，王元化被围遵化，形势危急，急派人到山海关求救。袁崇焕从各方面得到消息，他此刻对敌情的判断却出现了失误。上任以来，本是一直对后金绕道入犯忧心忡忡的袁崇焕，此刻他所担心的事实终于发生了，按说应该极其慎重，奇怪的是，袁崇焕对敌情的判断，出现了不应该有的轻敌。
　　接到遵化告急，袁崇焕迅速召集众将商议，会上众人对敌情的判断各不相同。袁崇焕表面上显得很轻松，说定是束不的勾结数千鞑子入犯，待他等关外大军来到，亲率众将入关将其一举剿灭。在祖大寿锦州大军到来后，袁崇焕点马步兵约两万入关勤王。一路西行入关之后，沿途种种迹象表明，此次入犯敌军，绝不止数千之众。接到赵率教全军覆没的战报之后，袁崇焕顿感事态严重，方觉得所带勤王兵力不足，再派人回辽东调取兵马，已经慢了一拍。后来袁崇焕被拿后，崇祯责问：关宁有兵十四万，因何只带万余兵马勤王？怀疑袁崇焕敷衍塞责，并非全无根由。

　　关宁兵马在熊廷弼时期有十八万，熊廷弼后来提出要增加到三十万才能扫灭后金。孙承宗时期有十一万，包括工匠杂役等一万余人。袁崇焕天启六年五月奏报关内关外合计九万二千余名，崇祯二年整顿营伍后定为关内四万，关外七万，合计十一万。十一万兵马，步兵为主。后金军队则是骑兵为主，铁骑冲突，风驰电掣，明军往往被冲击的七零八落，袁崇焕为了五年复辽，大力训练骑兵，以图与后金野战争锋，但面临缺马的难题，所以一再向朝廷申请买马拨给辽东。

　　十一万兵马，其中能战的精锐，估计不超过一半，这一点可以从后来恢复四城之战，参战的辽军祖大寿和马世龙两部总数四万七千人可以大致推算。
　　袁崇焕入关辽军总数二万，不及辽军精锐的一半，无怪乎崇祯对其严重不满。两万辽军对付同等数量的后金军可以一战，但皇太极此番是拼了血本，入犯金蒙联军达十万之众，袁崇焕如果与其正面交锋，无异于以卵击石。
　　十一月初十，袁崇焕军抢在皇太极之前驰抵京西门户蓟州，袁崇焕顿觉轻松，觉得大势尚有可为。安排刘策回师密云，制定方略上奏崇祯，并得到批准。袁崇焕的战略如同他在辽东之时，立足于一个守字，他在蓟州挡住皇太极，确保北京安全，皇太极回师向东西两个方面攻击，东面有他沿途布置的防守，西面有刘策指挥蓟州部队防守，后金左冲右突，捞不到大的油水，只能退出长城。此计划不可不谓完美，但只是一厢情愿，他低估了皇太极的胆略和智谋。

　　经过两次辽东与袁崇焕的交手，皇太极汲取了足够的教训。面对蓟州坚城，又得知袁崇焕严阵以待，皇太极没有继续碰壁，而是宁可冒着后路有敌的危险，潜越蓟州，直取北京。让袁崇焕依托蓟州城，凭借明军火炮优势，再次重挫后金的美梦落空。打破了袁崇焕全盘设想，对其心理造成了重大打击。
　　后人指责袁崇焕只晓得坐守蓟州，静等皇太极上钩，可谓愚蠢至极。不知袁崇焕有他的难言之隐，以他在蓟州的兵力，辽军加保定总兵曹鸣雷等部队，全数不过两万，如果不依托坚城，去平原旷野与后金大军决战，很可能重蹈赵率教的覆辙。此时的袁崇焕正如双腿残废之人，必须依托城池方可行动，因此皇太极不来攻城，他没有有效办法阻挡对方前进。

　　更为严重的是他在蓟州放出的豪言，绝不让后金西越蓟州一步，顿成空话，给他带来极大的麻烦。