——“地方系”，主要是指各地官绅自发组织起来的义师，将他们单独归成一类是有原因的。首先，这些人“反清”是必须的，但反了之后服从谁的领导很难说，鲁监国、隆武（郑成功代表）、永历都是可能的选择。如果觉得选谁都不合适，那就自己领导自己。其次，即便选择其中一个投靠，也仅仅是停留在口头上，实际上还是单打独斗。
　　三大派系的关系比较微妙，鲁监国指挥不动郑成功，郑成功也不敢拿鲁监国怎么样，地方义师更是抓瞎。尽管抗清的武装遍地开花（清浙闽总督张存仁曾向朝廷奏报福建“遍海满山，在在皆贼”），但基本上是各自为战。好在大家还比较能够顾全大局，互不干扰，只是缺乏统一的指挥调度，作战计划随心所欲，相互协同就更谈不上了。

　　有人说，福建这种各自为政的局面，极大地削弱了抗清武装的战斗力，为清军进取福建提供了便利。
　　我的看法正好相反，统一指挥是否能够提高战斗力，关键要看是否有人能够胜任。湖南倒是何腾蛟一个人说了算，结果大家一起大踏步溃败。后来的事实证明，凭朱以海、郑成功的战略眼光和战术水平，都不足以指挥“大兵团作战”。
　　在这种情况下，只有打乱建制、各自为战，不仅清军看着乱，自己都觉得相当乱，福建才有可能撑得更久。
　　此时的福建，确实已经成了一团浆糊！
　　“浙系”方面，鲁监国趁着清军兵力空虚，于永历元年（1647年）正月底在长垣誓师，着手准备收复失地。誓师之后，率先动作的是驻扎在海坛岛的周鹤芝，这可是一个传奇人物。
　　周鹤芝，字九元，福建福清人，海盗出身，早年在福建沿海劫富济贫、闻名乡里。在此期间，周鹤芝与倭寇打过交道，并让儿子拜倭寇首领撒斯玛为义父。崇祯时期，周鹤芝接受朝廷招安，昔日的海盗摇身一变成了“缉私警”。隆武时期，周鹤芝被任命为水师都督，调往舟山，协助黄斌卿防守舟山。
　　撒斯玛后来做上了倭国的大将军，周鹤芝就想凭借自己的“海外关系”去倭国借兵抗清。黄斌卿不同意，说中国人的事情还是中国人自己来解决，没必要引狼入室。性情刚烈的周鹤芝愤然离去，返回福建。郑芝龙决意投降清军，周鹤芝以死相谏未果，率部撤守海坛岛，继续跟清军死磕。
　　长垣誓师后不久，周鹤芝率兵攻占福清的海口镇，一度占领了近五个月。六月，清军攻陷海口，驻守在此的参谋林籥舞、总兵赵牧战死，周鹤芝被迫退守海坛火烧屿。
　　周鹤芝出师不利，急于求成的朱以海想“擒贼先擒王”，于二月初八派兵进攻福州。清军虽然兵力空虚，但留守部队也不是吃素的，更何况朱以海也没多少军队，省会福州根本就啃不动。
　　福州失利，朱以海只能退而求其次，先后派兵进攻兴化（今福建莆田）、福清。朱以海认为，驻守两地的都是前明降清将领，兴化是张应元，福清是张心裕，应该比较容易策反。

　　事实证明，朱以海还是太天真。张应元、张心裕比正儿八经的清军还要狠，铁了心地当叛徒，“浙系”军队再次败北。
　　七月，鲁监国决定亲征，调集郑彩、周瑞、周鹤芝、阮进等部，进攻福州，结果再遭败绩。
　　两次直取福州败北，朱以海认真吸取了教训，意识到凭自己手上的兵力，想打大城市是不可能了，搞“农村包围城市”才是王道。九月，朱以海出奇兵袭击福州外围的沿海地区，先后攻占罗源、连江两县，次月又光复了长乐、闽清、宁德等地。至年底，清军盘踞的省会福州稀里糊涂地成了前线，频繁遭到南明军队的“骚扰”。
　　鲁监国带着“浙系”军队（其实主力还是福建的郑彩），在福建毫不客气地攻城略地，大有喧宾夺主的气势，郑成功率领的“闽系”当然也没闲着。
　　永历元年（1647年）二月初一，郑成功率军攻克海澄，次日向漳州进攻，但兵力有限，没能攻下来。清军没让郑成功在海澄多待几天，二月初五便攻占海澄，郑军被迫撤退。六月，郑成功率军再次进攻漳州，还是没攻下来。
　　郑鸿逵、郑成功脱离郑芝龙的控制撤到金门，手上兵力不多，几个月来主要是制造战船兵器、募练兵勇、筹集粮草，守不住海澄、拿不下漳州实属正常。
　　看到朱以海的“浙系”越战越勇，自知实力不济的郑成功开始坐不住了。
　　八月，郑成功将“闽系”军队集结于桃花山，并联络御史沈佺期、光禄寺卿林桥升等起兵响应，发起了声势浩大的泉州战役。
　　驻守泉州的是清军提督赵国祚，还有溜石寨参将解应龙配合防守。郑成功的军队一攻城，解应龙就率军从溜石寨钻出来，袭击郑成功的侧翼和后路。
　　攻了几次城没攻下来，郑成功发现不对劲，怎么侧翼和后路总是被抄？郑鸿逵、郑成功商议，要想拿下泉州，首先得把解应龙干掉，省得他总是出来捣乱。
　　九月初三，郑成功以攻城为饵，引诱解应龙出击，并在半道上设伏，将解应龙的军队一举歼灭，并乘胜捣毁了溜石寨。
　　没有溜石寨的支援，泉州俨然成了一座孤城。赵国祚突然警觉起来，一面严密布置城防，一面紧急探查内应，几天时间就抓出了不少被郑成功策反的“眼线”。

　　泉州被围困，赵国祚密调漳州守将王进前来救援。王进倒是不敢抗命，但手上只有一千五百人，他必须掂量一下，到底是去救援，还是去送死？
　　王进灵机一动，谎称自己带着数万潮州援军，要直捣郑成功的老巢安平。为了将戏演得逼真，王进率军向安平方向一路狂奔。
　　“眼线”都被赵国祚干掉了，郑成功彻底抓瞎。得知潮州有数万人要杀到自己的老巢，郑成功果然中计，赶紧分兵撤守，留下郑鸿逵继续攻城。
　　郑成功率主力往安平撤，王进突然转向，以迅雷不及掩耳之势直抵泉州城下，与赵国祚里应外合，夹击郑鸿逵的攻城部队。郑鸿逵还没搞清楚从哪儿冒出来这么一帮人，便全线溃败，撤回金门。后来，郑成功得知王进的援军只有区区一千多人，肠子都悔青了，恨不得拿脑袋往墙上撞。