传习队是幕府引以为傲的、由法国军事顾问集团特别调教出来的洋式军队，手中所持的也都是新式武器，与鸟羽伏见战役中的旧幕府联合军相比完全就是两种不同的概念，现在的他们有足够的能力与新政府军展开枪炮的火拼。
　　前军（传习队、会津、桑名、新撰组等）在城外与新政府军展开了历时两个小时左右的火炮对轰，前军占了火力上的优势。入夜后，在土方指挥下会津、桑名两藩二十余人潜入城内并放火，杀了敌人一个措手不及。新政府军见大势不妙，便率军弃城逃走。
　　自第二次长州征伐以来，旧幕府虽坐拥大军却屡战屡败，四月十九日的宇都宫城一役才算是真正的大获全胜。在这场战役中土方充分地发挥了军事才能与领导能力，攻城战通常需要凌驾对方数倍的兵力，打的都是持久战；而土方在少人数作战的情况下竟然一日之内便将城池一举夺下，此事迹便成为了戌辰战争中的一段美谈广泛流传后世。

　　然而，败走的新政府军很快便等到了援军的到来，两方人马于二十三日合力攻城。由于前军（旧幕府军）陷入了弹药不足的困境，这次便吃了败仗撤退至日光。土方在这场战役中脚趾受伤，便与分队长秋月登之助一起退下火线，被送至今市养伤。
　　次日，土方在病床上叫来了天然理心流的同门——担当警卫的八王子千人同心的土方勇太郎，向他说明了十九日斩杀逃兵的详情。土方在叙述事情经过时双目含泪，并对勇太郎说道：“他也是个可怜人。”说完便给了勇太郎一包金子，叫他帮忙在日光给那可怜的逃兵立一座墓碑，以慰他在天之灵。
　　从山南敬助到宇都宫城战役时的逃兵，再加上众多被迫切腹的新撰组队士，一个个的同伴因土方而死，各种负面评价也铺天盖地迎面而来。大家看到的都是土方冷血、残酷的一面，他心里的挣扎与痛苦却没人看得到。世人熟知的“鬼之副长”的形象背后，隐藏的却是更多的无奈与矛盾，这个“鬼”未必就是土方真心想做的。
　　由于阵中医疗设施不完备，二十九日，土方与秋月被送往会津疗伤。与秋月分别之后，土方投宿于会津若松城下的清水屋。得知副长到来的消息，在下总流山因近藤拖延时间而获得逃走机会的新撰组队士便三三两两聚集于清水屋，曾经的新撰组总算是再度构成了原来的组织形态。
　　日期：2013-12-28 17:20:34
　　六十一、奥羽越列藩同盟
　　庆应四年一月十七日，新政府正式下达了会津征讨令，命令奥州仙台藩主伊达庆邦向会津出兵。征会号令一出，在奥羽方面掀起了轩然大波。孝明天皇才驾崩一年，他的大忠臣就被迫扣上“反贼”的帽子，遭遇讨伐的危机。松平容保成了奸贼，这是要把孝明天皇置于何地？要领兵灭了一个藩，必须拿出点让人信服的说法来。仙台藩（3.11大地震中被毁灭的仙台市）率先上奏建白书向新政府提出质疑：一、为承担黑船来航以来的政治失策，德川家经过大政奉还、王政复古，彻底结束了幕府的政治生涯，这背后是否有什么隐情？二、政，变（王政复古）以来政局动荡不稳，在这种情况下还要大动干戈发动战争，将万民置于水深火热之中，这真的是新帝所下的决断吗？三、长州藩在禁门之变中因向御所开炮而沦为朝敌，最终却得到宽大处理。但会津藩与旧幕府军在鸟羽伏见战役中只是因萨摩的先发攻击而采取了正当防卫，这样竟也被定义为“朝敌”，这如何服众？

　　但这封建白书才刚刚递交朝廷，征讨军便已经手持御锦旗出发前往奥羽。更令人震惊的是，连担任江户警卫工作的庄内藩竟也成为“朝敌”，下达了与会津同样的征讨命令，轰动了整个东北。直到公布了奥羽镇抚的负责人名单，奥羽诸藩总算是看出了端睨。两参谋之中大山格之助是萨摩人，世良修藏是长州人，会津在八月十八日的政变、池田屋事变、禁门之变等让长州吃尽苦头，而守护江户的庄内藩在萨摩人火烧江户城之后率兵围剿，不但烧了萨摩藩邸还杀死了五十多名藩士，这“征讨朝敌”哪里是什么大义名分，分明就是萨长两藩在公报私仇。对镇抚军团的疑惑及不满便野草一样，迅速在奥羽诸藩中蔓延开来。

　　奥羽镇抚军团于三月上旬从京都出发，由水路前往仙台藩领。一出发便遭遇了强西风侵袭，之后转为大雨，好不容易上了岸，风向又急速转北，并伴随着更为猛烈的暴风雨，众士兵在刺骨的寒风中一夜未眠。连老天爷都不欢迎这些打着大义名分旗号满足私欲的人。

　　仙台与会津相邻，两藩素来关系友好。虽说奉了朝命，仙台藩主也只是做做表面功夫，将五千大军驻扎至会津藩领，暗地里多次向松平容保派遣使者进行劝降工作。但这时会津已与处境相同的庄内同仇敌忾并秘密达成协议（会庄同盟），两藩清楚此番必然难逃征讨命运，便订下盟约齐心协力、共同御敌。
　　会津、庄内的征讨已迫在眉睫，参谋世良修藏多次催促仙台藩出兵，但仙台藩主对于会津持同情态度，将大军驻扎至会津领地后便再无动作，反而频繁与米泽藩共同商议如何减轻会津的处罚，并在会津城下召开了为期五日的交涉，总算是说服松平容保做出了对新政府投降的决定。
　　说动了松平容保，现在该说服镇抚军团了。但听说仙台藩无视三令五申下达的征讨命令，反而替贼军求情，世良修藏大发雷霆，当着仙台藩主的面放出狠话：要想赦免会津藩也可以，但为表示恭顺诚意，必须献上松平容保项上人头，再幽禁其子、会津无条件开城。达不到以上条件休想投降！
　　面对这样苛刻的归降条件，仙台藩也怒了。藩主伊达庆邦立刻与米泽藩主联名在白石城内聚集了奥羽列藩代表，召开“会津营救大会”，并联名作成了请愿书。翌日再附上会津藩的降书，越过参谋世良修藏直接送到了镇抚总督九条道孝的手中。诸侯联名上奏，九道总督自然也是不敢怠慢，当日便以受理的态度收下了诸侯、会津的请愿书。事情本应是进展顺利，但因世良的强烈反对之下，九道总督也由最初的软化态度转为不予受理，任凭会津三番四次向朝廷上奏降书，却没有一封能够平安转达京都。

　　当时在仙台藩有一首流行的民谣：
　　九丈梯子挂半钟，
　　明明无火事信号，
　　为何还要撞？
　　这首民谣之内全部采用了谐音，“九丈”就是九条，指的是九条总督；“火事”指的是罪过、“信号”指的是会津；“撞”指的是攻打。整首合起来的意思就是：“九条总督已收请愿书，明知会津本无罪，为何还要攻打？”对于新政府的蛮横无理，再加上对萨长联盟的反感，奥羽列藩以仙台、米泽为首，主张对会津宽大处理，放过藩主一家性命。
　　然而世良修藏执意要灭了会津，在给另一位参谋大山格之助的书信中写道“奥羽皆敌”，并针对仙台藩主进行了一些诋毁中伤。写好了信，世良便带上一位侍从，到福岛城下的游郭花天酒地去了。