袁崇焕既已被拿，皇太极自没什么顾忌了。在京南晃悠了一圈后，掉转头来，二次向北京杀去。路上得到情报，有明朝副将申甫带领一哨人马在卢沟桥驻扎，皇太极当即命右翼五旗前去攻击。
　　申甫凭三寸不烂之舌，凭空得了一个副将，好不得意。崇祯又以罕见的慷慨拨给他十七万两银子作为军费，申甫当即风风火火的在京城招募士兵，北京街头的的市井无赖、游棍乞丐，一见只要报名就有吃有喝，何乐而不为，纷纷踊跃而来。至于上了战场随时可能送命，他们不曾想到，也没兴趣想知道。申甫也不管这些，只要有人报名，一律笑纳，半日之内，招到七千。到兵部领了刀枪火器，立马开始操练。

　　过了几天，崇祯想起这回事来，派大学士成基命去检阅申甫军队，成基命去了一看，队不成列、盔歪甲斜、弓拉不开、刀舞不动，鸟铳火炮更是一窍不通，看的成阁老连连摇头，回去之后，向崇祯报告，说申甫军队万万靠不住，崇祯却不以为然，斥责成基命心存偏见，看不起草泽奇士。随即，命申甫出城破敌，十六日，申甫领旨率军来到卢沟桥。
　　立足未稳，后金军杀到，慌忙迎战，结果可想而知，不到一盏茶功夫，全军覆没，而且毫无抵抗之力，都是跪而受刃，惨不忍睹。这位草泽奇士申甫副将，在后金铁骑冲突之际，并没有显示出什么特异功能，既不能呼风唤雨、水火搬运、甚至调发六丁六甲、天兵天将灭了后金，也未能化作一道白光或者运用奇门遁甲之术逃之夭夭，而是当场阵亡，右耳削去，左眉刀伤一处，左胳膊砍伤二处，骨断，右胯上刀伤一处，头颅上刀砍一处，身上更有箭伤数孔。

　　战争是一种专业化的人类活动，战场上万马奔腾、千军呐喊，场面宏大固然令人心驰神往，上阵杀敌、为国尽忠，青史名标诚然使人激动，但是更要看到，战争意味着血淋淋的杀戮，令无数人心潮澎湃的战场更是无情而冰冷的。 军人是一种职业，需要专门化的训练才能担任，不是普通人一拿武器就可以马上上战场杀敌立功。《孙子兵法》云：不教而战谓之杀！如果将未经严格训练的民众送上战场，无异于将其送入屠场。虽然申甫死得很壮烈，这一点不应该抹杀。

　　全歼申甫所部，当晚后金军在附近安营。副将阿山擒获一名明军游兵，经审讯，得知永定门外二里许，有满桂、黑云龙、麻登云、孙祖寿四总兵统兵四万扎营。皇太极立即传令，三鼓进兵。
　　满桂被任命为武经略后，喜忧参半。喜的是皇上对自己如此信任，又是封侯，又是拜帅，委以节制各路军马大权。忧的是后金军虽暂时退出北京，但还在京郊一带出没，随时可能再向北京扑来，北京之围说解未解。更为糟糕的是，圣旨命他总理辽军，谁知祖大寿不由分说把全部辽军拉回了辽东，他这个辽军总理已无兵可总。从大同带来的五千精锐骑兵，经顺义和德胜门两败之后已所剩无几。现在满桂手下的兵马，除了他本部外，主要有侯世禄残部、京营选锋、黑云龙、麻登云、孙祖寿三人所部家丁千余人及刚刚到京的大同巡抚张宗衡所部（张宗衡本月初十督兵入援，崇祯指示他一到北京，就把兵马留下交给满桂，张宗衡本人即刻回大同），合计约马步兵四万。

　　满桂接任武经略，取代袁崇焕成为北京保卫战的总司令，深感担子不轻，自不敢怠慢，积极招抚败兵，补充武器装备，在瓮城内日夜操练人马。没过几日，崇祯下旨，命满桂刻日进兵，满桂解释说目前敌劲援寡，未可轻战。崇祯不允，再三派太监催战，满桂迫不得已，挥涕而出，哭着领兵出城，在永定门外二里列营。
　　战争者。兵戈之事也，本来就带有肃杀之气，如正逢严冬，杀气更增。
　　本年北京的冬天格外寒冷，十二月十四、大雪盈尺；十五，又降大雪，天气极寒。户部平日所用给城外援军战马运送草束的车脚皆逃，每一辆来运草料。实在没有办法，毕自严命户部衙门十三司官自率其胥役，背负肩挑，各运一千五百束。这些官老爷平日里遇到这种严寒天气，都是躲在暖阁和妻妾们围炉饮酒，今日却在尚书大人威逼之下，不得不顶着凛冽的寒风，背着一捆捆干草，一瘸一拐的艰难跋涉。

　　十六日，大雪总算停了，天气却冷得奇寒彻骨。黎明时分，后金大军向永定门杀来。满桂得报，急忙迎敌，明军布阵还是坚持传统，枪炮火器摆在前面，看到敌军进入射程之内，一起发放，步骑兵在后，阵前斩木为栅，并撒放地雷、鹿角、铁蒺藜等物以阻止敌骑兵冲撞。
　　这次，皇太极别出心裁，用抢来的数千骡马每匹挂两颗火炮火罐，赶着向前急冲，后金蒙古骑兵紧随其后，一齐冲入明军阵地。顿时间，枪炮齐发，硝烟弥漫，明军猝不及防，第一波的枪弹打在无人的后金骡马上，骡马哀嘶倒地，幸存的闯入明军，马背上的火炮纷纷爆炸，炸的明军血肉纷飞，阵势大乱。继而，后金铁骑冲了过来，明军继续放炮轰击，炮弹炸处，数里之外应声而毙，数千鸟铳手一起蹲下，开枪射击，铅子如雨金蒙骑兵纷纷落马。皇太极在后阵督战，看到此处，禁不住心伤陨涕。明军火器虽然厉害，但当后金骑兵付出重大伤亡，冲到明军阵前之时，火器的作用消失了，而后金军精于骑射的长处发挥出来了，明军顿时抵挡不住，再加上众寡不敌，后金军约是明军两倍之众。尽管明军将士奋勇抵抗，最后还是全军覆没。满桂、孙祖寿战死，尸首无存，麻登云、黑云龙被生擒。

　　孙祖寿是原蓟镇总兵，天启七年宁锦之战时，因被弹劾逗留不战而被免职。孙祖寿年轻时，镇守河北固关，担任基层武官把总（亦称百总），一次生了重病，连续七天，他的妻子割下手臂之肉，熬汤给孙祖寿喝。后来孙祖寿病好，孙妻却因此而亡。孙祖寿悲痛万分，从此不接近女子。即便是当了总兵之后。
　　麻登云是孙祖寿的的后任，出身将门。明末有两大将门，“西麻东李”，东李指辽东宁远伯李成梁一家，西麻就是陕西麻家。本年春，因蓟州兵变被撤职。现因军情紧急，崇祯启用了大批闲居的废将，孙麻二人也在其中。
　　京城内居民，五鼓时分还在睡梦之中，被隆隆炮声惊醒，意识到城外发生恶战。待到天亮日出，街上人声鼎沸，庆祝胜利的人相属以路，人们奔走相告说明军在城外大败贼军，杀得敌军匹马不还。城中居民万众欢腾，无论贵贱，一齐欢欣鼓舞，敲锣打鼓，热烈庆祝。直到第二天方才知道，原来是明军全军覆没，北京城内顿时人心大震永定门之战，明军马步四万，一掷而空。
　　后金退出北京之后，京兆尹刘宗周带人出城掩埋遗骸，拾得遗骸三万多具。后金伤亡数字不详，“杀敌一千自损八百”古有明训，况且，满桂等人也素以勇猛著称，后金伤亡应该不少。因为后来清朝是胜利者，所以凡对其不利的都刻意掩饰。《清太宗实录》云，“敌军矢石鸟枪如雨，我军无一伤者”，如此记载，可谓神来之笔，令后人叹为观止。